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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004148`

染色体: Chr03 坐标: 60297213-60304349 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004148`
名称	SmilChr03G004148
描述	uncharacterized SmilChr03G004148
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60297213 - 60304349 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015018`
GeneID	`131015018`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015018`
原始查询	`SmilChr03G004148`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842129]; symbol=AT1G57540; hit=AT1G57540; species=arabidopsis; confidence=high
产物	40S ribosomal protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842129]; symbol=AT1G57540; hit=AT1G57540; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G57540` (AT1G57540) 40S ribosomal protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842129] identity=76; qcov=1; evalue=3.09e-52; confidence=high
Rice	`Os01g0250600` - identity=76.6; qcov=0.979; evalue=3.55e-52; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25285 (DUF7875)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015018

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057799196.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057799196.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057799196.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799196.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799196.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60300325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:60300343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr3:60300386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr3:60301215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr3:60301270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:60301311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799196.1

96 aa

DUF7875

PF25285 DUF7875 1-95 aa

XP_057799197.1

96 aa

DUF7875

PF25285 DUF7875 1-95 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799196.1`	Pfam	`PF25285`	DUF7875	Domain	1	95	5.7e-54	181.1	Domain of unknown function (DUF7875)
`XP_057799197.1`	Pfam	`PF25285`	DUF7875	Domain	1	95	5.7e-54	181.1	Domain of unknown function (DUF7875)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

9 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098433.1
CTGCCTTGCTCCGCACTGCCTTGCTCTACTCCGGTCCGCCGTGCTTCGCCGCCGCTCCCATCTTCTCCGGTCGCCGTCACCCCTCCTCGAAGGCCATCTGCCATTGCGGCCGTGAGCTTCCGGTGAGGCCGCCGCTGGTATTCAATTGGAAGGCAAAGCAATCGAAGCAGAATAGACAATGGCTCTAAGGCGTATGCTTGGATTCTCTGATGGAGAATTGATGCGGTCGGATGCAAAACCATGTTCGCGACTGATGAGGC...

XR_009098431.1
CTGCCTTGCTCCGCACTGCCTTGCTCTACTCCGGTCCGCCGTGCTTCGCCGCCGCTCCCATCTTCTCCGGTCGCCGTCACCCCTCCTCGAAGGCCATCTGCCATTGCGGCCGTGAGCTTCCGGTGAGGCCGCCGCTGGTATTCAATTGGAAGGCAAAGCAATCGAAGCAGAATAGACAATGGCTCTAAGGCGTATGCTTGGATTCTCTGATGGAGAATTGATGCGGTCGGATGCAAAACCATGTTCGCGACTGATGAGGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015018
ATGGCTCTAAGGCGTATGCTTGGATTCTCTGATGGAGAATTGATGCGGTCGGATGCAAAACCATGTTCGCGACTGATGAGGCACACTGCTGGCATTTGTTCAGTCGGAGGAGCATTGGGCTTTTGGACGCTCTGCCGCTTGTATTATGGTCCTAGAATAACAGTTCCTCGAACTCTTAGGTGGGCTGCTTGTGGTGCTGTCTCCATGAGTGCAACCACAGCTTTGTTAGTTCGTCTACTCAGCCCTGAATGTGAACCCCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799196.1
MALRRMLGFSDGELMRSDAKPCSRLMRHTAGICSVGGALGFWTLCRLYYGPRITVPRTLRWAACGAVSMSATTALLVRLLSPECEPQNIAAYDQKR

XP_057799197.1
MALRRMLGFSDGELMRSDAKPCSRLMRHTAGICSVGGALGFWTLCRLYYGPRITVPRTLRWAACGAVSMSATTALLVRLLSPECEPQNIAAYDQKR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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