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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004160`

染色体: Chr03 坐标: 60385230-60388493 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004160`
名称	SmilChr03G004160
描述	glutamate receptor 2.1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60385230 - 60388493 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015030`
GeneID	`131015030`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015030`
原始查询	`SmilChr03G004160`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutamate receptor 2.1-like
产物	glutamate receptor 2.1-like
Arabidopsis	`AT2G29120` (GLR2.7) glutamate receptor 2.7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817460] identity=48.9; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0429000` (OsGLR2.1) - identity=44.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004970 (glutamate-gated receptor activity); GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00060 (Lig_chan); PF00497 (SBP_bac_3); PF01094 (ANF_receptor); PF10613 (Lig_chan-Glu_bd); PF13458 (Peripla_BP_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015030

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057799207.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799207.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799207.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799207.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799207.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60385443`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr3:60385443`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D11
`Chr3:60385529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B130,B131
`Chr3:60385550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:60385599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B130,B131
`Chr3:60385622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B130,B131,C38
`Chr3:60385807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr3:60385869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B29,B36,C26
`Chr3:60385893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B14,B60,C42
`Chr3:60386087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,B97,C86
`Chr3:60386154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr3:60386418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799207.1

919 aa

460

919

Peripla_BP_6

ANF_receptor

Lig_chan-Glu_bd

SBP_bac_3

Lig_chan

PF13458 Peripla_BP_6 40-371 aa PF01094 ANF_receptor 48-391 aa PF10613 Lig_chan-Glu_bd 468-557 aa PF00497 SBP_bac_3 470-791 aa PF00060 Lig_chan 574-826 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799207.1`	Pfam	`PF13458`	Peripla_BP_6	Family	40	371	4.1e-17	63.6	Periplasmic binding protein
`XP_057799207.1`	Pfam	`PF01094`	ANF_receptor	Domain	48	391	1e-71	242.6	Receptor family ligand binding region
`XP_057799207.1`	Pfam	`PF10613`	Lig_chan-Glu_bd	Domain	468	557	1.9e-09	38.3	Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site
`XP_057799207.1`	Pfam	`PF00497`	SBP_bac_3	Domain	470	791	4.5e-09	36.9	Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
`XP_057799207.1`	Pfam	`PF00060`	Lig_chan	Family	574	826	5.4e-36	124.3	Ligand-gated ion channel

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943224.1
AATAATCCATTGACTTCACATTAGTAAACTCCAATTATAGTCTCATCTTTCACGCATTCCCTCTTATATATCTCAACTCTTGCTCCCTTCAAAACACATGTACAGATGGAGAAGACAATCCATCCCATTTTGCTCTACTTGTTTCTCTCAAACCTTCTCTGCTCAAAAATGGCATCTGCACAAACCATCCCCATAAGAGTTGGAGTAGTTCTTGAAATGAATAATTATGGAGAGATGACCTTCAACTGCTTATCAATGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015030
ATGGAGAAGACAATCCATCCCATTTTGCTCTACTTGTTTCTCTCAAACCTTCTCTGCTCAAAAATGGCATCTGCACAAACCATCCCCATAAGAGTTGGAGTAGTTCTTGAAATGAATAATTATGGAGAGATGACCTTCAACTGCTTATCAATGGCCCTCTCCGACTTCTACTCCTCCCACCAACACTACAAGACCAGGCTCCTCCTCACCTCCCGCCACTCCAAAGGCGACGTCGTCGGCGCCGCCGCTGCAGCCTTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799207.1
MEKTIHPILLYLFLSNLLCSKMASAQTIPIRVGVVLEMNNYGEMTFNCLSMALSDFYSSHQHYKTRLLLTSRHSKGDVVGAAAAALDLLRNVEVQAVIGPTFSMQASFLISLGDTAHVPVVSFSATSPSLSSIRSPYFVRATLSDASQVDAIGALVAAFGWREVVPVYEEDDFGEGIMPYLSDALVRANARIPYRSVVPPLASDVQIEAELYKLMTMQTRVFVVHMMSSLASRLFTVARRIGLMSPDSVWIVTNGVTNEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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