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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004162`

染色体: Chr03 坐标: 60392083-60393964 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004162`
名称	SmilChr03G004162
描述	glutamate receptor 2.7-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60392083 - 60393964 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015033`
GeneID	`131015033`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015033`
原始查询	`SmilChr03G004162`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutamate receptor 2.7-like
产物	glutamate receptor 2.7-like
Arabidopsis	`AT5G11210` (GLR2.5) glutamate receptor 2.5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830991] identity=35.5; qcov=1.12; evalue=2.07e-85; confidence=medium
Rice	`Os02g0787600` (OsGLR1.2) - identity=39.6; qcov=0.966; evalue=7.59e-82; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0015276 (ligand-gated monoatomic ion channel activity); GO:0038023 (signaling receptor activity)
KEGG	-
Pfam	PF00060 (Lig_chan)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015033

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057799210.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799210.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799210.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799210.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799210.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60392365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C59
`Chr3:60392391`	`G`	`GT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	8	A4,B103,B107,B130,C46,C54,C61,C7
`Chr3:60392412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C52
`Chr3:60392427`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B103,B32,C52
`Chr3:60392427`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B103,B32,C52
`Chr3:60392435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B32,C52
`Chr3:60392569`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A18,A22,B112,B42,B56,B96
`Chr3:60392684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:60392716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr3:60392792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr3:60392796`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	134	A1,A10,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A22,A3,A4,A9,B10,B102,B103,B105,B106,B107,B110,B111,B112,B118,B119,B12,B121,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B134,B136,B137,B140,B15,B16,B19,B21,B25,B29,B30,B31,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B45,B46,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B55,B56,B58,B62,B65,B66,B69,B71,B72,B74,B75,B79,B8,B80,B84,B86,B88,B89,B90,B92,B94,B96,B99,C1,C10,C11,C14,C18,C19,C2,C22,C26,C27,C28,C3,C33,C35,C37,C38,C39,C4,C43,C44,C46,C49,C5,C50,C54,C56,C57,C58,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C69,C7,C74,C75,C76,C77,C78,C81,C83,C84,C85,C87,C9,D10,D5,D7,D9
`Chr3:60392799`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	134	A1,A10,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A22,A3,A4,A9,B10,B102,B103,B105,B106,B107,B110,B111,B112,B118,B119,B12,B121,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B134,B136,B137,B140,B15,B16,B19,B21,B25,B29,B30,B31,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B45,B46,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B55,B56,B58,B62,B65,B66,B69,B71,B72,B74,B75,B79,B8,B80,B84,B86,B88,B89,B90,B92,B94,B96,B99,C1,C10,C11,C14,C18,C19,C2,C22,C26,C27,C28,C3,C33,C35,C37,C38,C39,C4,C43,C44,C46,C49,C5,C50,C54,C56,C57,C58,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C69,C7,C74,C75,C76,C77,C78,C81,C83,C84,C85,C87,C9,D10,D5,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799210.1

475 aa

238

475

Lig_chan

PF00060 Lig_chan 221-464 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799210.1`	Pfam	`PF00060`	Lig_chan	Family	221	464	1.3e-20	74.4	Ligand-gated ion channel

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943227.1
AGCAAAATGAAATTGGTTGGTGGCTGCCATTTTTGACTAACAACATTCCCCCTATATATATACACTTAAAATTGCTGAAATTAATTTTCCATATATCTCAACTTTGATAGCTAGAAATCTAACCAGCAAAAGACATAGATGGAGAAGAGAATCCATCCCATTTTGCTTTACTTGTTGTTATCAAACATATTGAGCTCAGCATCGCAGACTCTCCCCATAAGAGTTGACATGACTCTCCCCATAAGAGTTGACATGGTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015033
ATGGAGAAGAGAATCCATCCCATTTTGCTTTACTTGTTGTTATCAAACATATTGAGCTCAGCATCGCAGACTCTCCCCATAAGAGTTGACATGACTCTCCCCATAAGAGTTGACATGGTTGAATATTCATATATGACCTTCAACCGCTTATCAATGGCGCTTTCAGACTTGAATTCTCACACATCCATGTCGATGAACTCTAGTGAGGGATTCAGGGCCTGGGATGAAGCCTTGTCAATCACCACACTCAAAGGCCTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799210.1
MEKRIHPILLYLLLSNILSSASQTLPIRVDMTLPIRVDMVEYSYMTFNRLSMALSDLNSHTSMSMNSSEGFRAWDEALSITTLKGLALSFCVVHGVWGLGYWKEENEIVKSKLASIIWPGEASASPRGWVVPTNGKKLRVGVPVKAGFTEFVSVTWNPNNSVRVEGYCIDVFDAVMAALPYGVPYESIELTYAVDLGEIDTAAADTIVDFTLQPYTGQRVISICSFFFIVFFIWILEHLINQNLKGFWYQVGMTFWCAFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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