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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004165`

染色体: Chr03 坐标: 60415687-60421960 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004165`
名称	SmilChr03G004165
描述	choline/ethanolaminephosphotransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60415687 - 60421960 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015035`
GeneID	`131015035`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015035`
原始查询	`SmilChr03G004165`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	choline/ethanolaminephosphotransferase 1-like
产物	choline/ethanolaminephosphotransferase 1-like
Arabidopsis	`AT1G13560` (AAPT1) aminoalcoholphosphotransferase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837917] identity=81.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0119800` - identity=74.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008654 (phospholipid biosynthetic process); GO:0016020 (membrane); GO:0016780 (phosphotransferase activity, for other substituted phosphate groups)
KEGG	smil00440 (Phosphonate and phosphinate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00565 (Ether lipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01066 (CDP-OH_P_transf)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015035

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057799211.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057799211.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057799211.1`
4	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057799211.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799211.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60416113`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A10,A13,A20,A24,A8,B11,B28,B36,B46,B47,B62,B80,B95,B96,C17,C30,C4,C44,C55,C60,C62,C77
`Chr3:60416334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B132,B32,B37
`Chr3:60416339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B27,C15
`Chr3:60416603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B77
`Chr3:60416603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr3:60416604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B36
`Chr3:60416604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr3:60416611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,B71
`Chr3:60416617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B53,B71,B82,D5
`Chr3:60416625`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A22,B108,B117,B123,B138,B4,B48,B56,C23,C40,C44,C48,C67,C69
`Chr3:60416746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B126,B33,B7,C58
`Chr3:60416759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799211.1

389 aa

194

389

CDP-OH_P_transf

PF01066 CDP-OH_P_transf 45-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799211.1`	Pfam	`PF01066`	CDP-OH_P_transf	Family	45	152	7.1e-09	37.0	CDP-alcohol phosphatidyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943228.1
ATTAGAAATTAGAAGTTTCTGATCTCTCTTCTCACCACTGTTCGCTCGCTCTCTTTCACTCTCTCTCGGTCTCTCTCTCAGCCGCCGGTCGCCCGTGGCCACGGCCTCGCCGCCTCGGAAAACTCCGTCAAGCGCTGCGATTTGCAAGCGCCAAGCAGGCAGCACAGCAGCAGTGTGCCGCCCAGCCCTCGCCGGCTCGCCCCGCCCCGTCTCCTTCGATCGACAGCTGCAGTGCGACTGCGCAGCGCCTCTCTCACCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015035
ATGGGATACATTGGGGCTCATGGAGTTGCGGCGTTGCGCAAGCACAAGTATAGCGGAGTTGATCACTCCATAGTGTCGAAATACGTGCTTCAGCCTTTTTGGACCCGCTGCGTCAACTTATTCCCTCTCTGGATGCCACCTAACATGATTACACTTATAGGATCGATGTTTTTGGTTACATCTGCACTACTTGGATATATATACTCACCTCAACTGGATTCGCCTCCTCCGAGATGGGTTAATTTTGCCCATGGATTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799211.1
MGYIGAHGVAALRKHKYSGVDHSIVSKYVLQPFWTRCVNLFPLWMPPNMITLIGSMFLVTSALLGYIYSPQLDSPPPRWVNFAHGLLLFLYQTFDAVDGKQARRTNSSSPLGELFDHGCDALGCAFEALAFGSTAMCGGSTFWFWVISAVPFYCATWENYFTNTLILPIINGPTEGLLLIYMVHFFTAIVGTEWWAQQFGKSIPFFSWVPFVNELPMYKAALFMMILFAVIPTVSFNVYNVYKIVRARKGSMLLALAMLY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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