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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004167`

染色体: Chr03 坐标: 60429488-60431038 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004167`
名称	SmilChr03G004167
描述	xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60429488 - 60431038 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015038`
GeneID	`131015038`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015038`
原始查询	`SmilChr03G004167`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 3-like
产物	xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 3-like
Arabidopsis	`AT3G25050` (XTH3) xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822096] identity=44.1; qcov=1.07; evalue=2.71e-73; confidence=medium
Rice	`Os06g0237400` - identity=37.6; qcov=1.11; evalue=5.17e-60; confidence=medium
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0010411 (xyloglucan metabolic process); GO:0016762 (xyloglucan:xyloglucosyl transferase activity); GO:0042546 (cell wall biogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF00722 (Glyco_hydro_16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015038

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057799213.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057799213.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057799213.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799213.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799213.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60429659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,B86
`Chr3:60429737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:60429772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr3:60430910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799213.1

266 aa

133

266

Glyco_hydro_16

PF00722 Glyco_hydro_16 27-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799213.1`	Pfam	`PF00722`	Glyco_hydro_16	Domain	27	200	7e-50	169.6	Glycosyl hydrolases family 16

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943230.1
TATGATTTGAATAATCCTCCCGCTCTACATGTGCCTATTTATATAGCAATTAAAATTTGAAGCATTCGCAAATTATAAATCAAAGAACTAATAGTAATCATTCTTGGTAGCTCATCAACTCTTCCATGGCTATTCGCATTGCTATCATACTAGTTTTCATTTCTGTTTTTTTAATGCAAGAAATTCTTGCACAAAATAGTTTTGATAAATACTATGACCCTCTATGGGGATTGAATCACATCACAGTTGATCCTCAAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015038
ATGGCTATTCGCATTGCTATCATACTAGTTTTCATTTCTGTTTTTTTAATGCAAGAAATTCTTGCACAAAATAGTTTTGATAAATACTATGACCCTCTATGGGGATTGAATCACATCACAGTTGATCCTCAAGGAACTGAAGTTCAACTTTTGATGGATCAGTCATCAGGCGCTGGATTTAGGTCAAAATTGGAGTATGGGTCAGGGTTGTTTCACATAAGGATGAAGATACCAGAGAAAAGAACTGGAGGAATAGTTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799213.1
MAIRIAIILVFISVFLMQEILAQNSFDKYYDPLWGLNHITVDPQGTEVQLLMDQSSGAGFRSKLEYGSGLFHIRMKIPEKRTGGIVTTFYLTSAPDNQPPNNHFEIDYEFIGTNGTVQTNVYNNDEGHREQSFNLWFNPSQDFHTYEILWNSRQIVFLVDSIPIRVFKNNTAQGIDYPWKPMHIEASIWNANWAGDVDWTQAPFVAHFEDFGFKACEANAGDCSRDSYWEFDDEQKRKMQQFRRSSMTYDYCSQPSTSKP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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