当前解析结果
SmilChr03G004183| 统一新 Gene ID | SmilChr03G004183 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G004183 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G004183 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 60543109 - 60547827 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131015054 |
|---|---|
| GeneID | 131015054 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131015054 |
| 原始查询 | SmilChr03G004183 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131015054 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057799235.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057799235.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057799235.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057799235.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057799235.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:60543393 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 12 | B114,B138,B14,B23,B44,B97,C19,C28,C51,C54,C55,C74 |
Chr3:60543396 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C72 |
Chr3:60543396 |
A |
AT |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | C72 |
Chr3:60543437 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A20,B121 |
Chr3:60543743 |
C |
CAG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 19 | A14,B103,B119,B122,B130,B19,B24,B60,B65,B84,B93,C2,C23,C31,C36,C42,C47,C56,C78 |
Chr3:60543754 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:60543817 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B118,B18,B4,B63,D11 |
Chr3:60543851 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B107 |
Chr3:60543900 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B87,B95,C78 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。