当前解析结果
SmilChr03G004184| 统一新 Gene ID | SmilChr03G004184 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G004184 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G004184 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 60548327 - 60552511 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131015055 |
|---|---|
| GeneID | 131015055 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131015055 |
| 原始查询 | SmilChr03G004184 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131015055 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057799236.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057799236.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057799236.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057799236.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057799236.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:60548379 |
C |
CTT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 26 | A10,A15,A18,B10,B107,B127,B129,B134,B139,B17,B29,B34,B56,B58,B66,B73,B96,B98,C18,C40,C42,C43,C58,C62,C65,D3 |
Chr3:60548419 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B111,B85,B90,B92,C48,C87 |
Chr3:60548481 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B85,B92,C48,C87 |
Chr3:60548495 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B134,B56,C42,C58 |
Chr3:60548495 |
A |
AT |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | B134,B56,C42,C58 |
Chr3:60548526 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B37 |
Chr3:60548527 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B37 |
Chr3:60548527 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B37 |
Chr3:60548565 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B137,C54,C6,C83 |
Chr3:60551162 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
Chr3:60551523 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
8 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。