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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004185`

染色体: Chr03 坐标: 60553565-60555593 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004185`
名称	SmilChr03G004185
描述	uncharacterized SmilChr03G004185
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60553565 - 60555593 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015059`
GeneID	`131015059`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015059`
原始查询	`SmilChr03G004185`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Peptidyl-tRNA hydrolase II (PTH2) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830935]; symbol=AT5G10700; hit=AT5G10700; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Peptidyl-tRNA hydrolase II (PTH2) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830935]; symbol=AT5G10700; hit=AT5G10700; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G10700` (AT5G10700) Peptidyl-tRNA hydrolase II (PTH2) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830935] identity=63.8; qcov=1.01; evalue=2.12e-74; confidence=high
Rice	`Os04g0605200` - identity=76.3; qcov=0.682; evalue=1.16e-57; confidence=high
GO	GO:0004045 (peptidyl-tRNA hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01981 (PTH2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015059

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057799241.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057799241.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057799241.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799241.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799241.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60553817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr3:60553823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:60553914`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B103
`Chr3:60553914`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B103
`Chr3:60553933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B56,B96
`Chr3:60553990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr3:60554057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C40,D10
`Chr3:60554059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,C77
`Chr3:60554087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:60554110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B4,B87,B91,B95,C43
`Chr3:60555434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799241.1

173 aa

173

PTH2

PF01981 PTH2 60-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799241.1`	Pfam	`PF01981`	PTH2	Family	60	172	1.3e-24	87.3	Peptidyl-tRNA hydrolase PTH2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943258.1
ATGTTGTCGAAAAACTTAATAATAATGAATCCTAGTTCTCAAATTAATTCATCCGGTGTGCAAAACCAAATTTCTTGTGAATTCATTTGATTTTTCTCTTAATTATAAATGAAATTATATTTGATCAAATCAATAATTTCTGGGCATAAAACGTAATGTCCATTTCCTTTTTTCTTTTTACGCAATTTAAGGTTTATTAAAATCTTTCACAATATTCCCGAGAGTGTGAATGGCTGCTTCTATGCTGATGCCCCATTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015059
ATGGCTGCTTCTATGCTGATGCCCCATTTCCCTCTTTTAAACCCGCAGTTTCACACTCGGACCGCTAAAACCACTCTAAGAAGCGCCGTCTGTTCACGCGCCGCCGCGCGAATGGAGTCGTCCGCCGCCACCAACGCAACGGCGGACTCCGCCGCCGCCGTCCAGGACACGGTGGTGGTGCAGTACGTTGTGCTGCGGAGGGACCTAATCGACACGTGGCCGCTGGGGAGCGTGGTAACACAGGGCTGCCATGCCTCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799241.1
MAASMLMPHFPLLNPQFHTRTAKTTLRSAVCSRAAARMESSAATNATADSAAAVQDTVVVQYVVLRRDLIDTWPLGSVVTQGCHASVAAIWTHKDDPDTLSYCSPPNLDSMHKVTLEVKGETQLLNLSEKLKSGGVAHKLWIEQPENFPTCLATKPYPKCTVSSFFKKLKLCK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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