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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004191`

染色体: Chr03 坐标: 60584205-60587429 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004191`
名称	SmilChr03G004191
描述	COP9 signalosome complex subunit 5a-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60584205 - 60587429 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015066`
GeneID	`131015066`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015066`
原始查询	`SmilChr03G004191`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	COP9 signalosome complex subunit 5a-like
产物	COP9 signalosome complex subunit 5a-like
Arabidopsis	`AT1G22920` (CSN5A) COP9 signalosome 5A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838899] identity=80; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0654700` (Osjab1) - identity=76.7; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000338 (protein deneddylation); GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008180 (COP9 signalosome); GO:0008237 (metallopeptidase activity); GO:0019784 (deNEDDylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01398 (JAB); PF18323 (CSN5_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015066

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057799259.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057799259.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057799259.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799259.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799259.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60584569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B133,C33,C35,D10
`Chr3:60584570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B134,B34,C36
`Chr3:60584597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C56,D3
`Chr3:60584621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:60584921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr3:60584923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C48
`Chr3:60585613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr3:60586232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B134,B34,C36
`Chr3:60586238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B29,B36,C26
`Chr3:60586978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:60587157`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B31
`Chr3:60587157`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799259.1

363 aa

182

363

JAB

CSN5_C

PF01398 JAB 63-175 aa PF18323 CSN5_C 263-342 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799259.1`	Pfam	`PF01398`	JAB	Domain	63	175	2.5e-36	124.8	JAB1/Mov34/MPN/PAD-1 ubiquitin protease
`XP_057799259.1`	Pfam	`PF18323`	CSN5_C	Domain	263	342	2.1e-26	93.2	Cop9 signalosome subunit 5 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943276.1
GTTTATCTTGTTAACTTAACCCCCTGGGCAACATTTAAATTATTCCATTTAAGTACTCGAAAAAGAAAATTAATGTAGTATAGTATTTCACAATTTTATCAAAAAATGGATTTACGTATCATATTAATCTTCGTATTTGAAATTTTAGATATTGGTTTCTATGTATTTATTTTTTATTGTTTTCTAATTTAATTAAGATAATTCCTTAGGTATTCATAATGTTTCCAAAATACTATAAAGAGGAATGGAGGCCATTTAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015066
ATGGATCCTCCTCCCCTTCCCCTTCCTTCCGCCACCATTGCGCGCCAGACATGGGAGCTCGAGAACAACATCGTGACGACCGCCGCCGGCGACTCGTCCTCCGCCACTTCGGACGCCATCTTCTTCTACGACGAGGCGGCGCAGGTCAAGTGCCAGCAGGAGAAGCCCTGGGCGAACGACCCCAACTACTTCAAGCGCGTCAGGATATCCGCCCTCGCGCTGCTCAAGATGGTGGTGCACGCTCGCTCCGGCGGTACCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799259.1
MDPPPLPLPSATIARQTWELENNIVTTAAGDSSSATSDAIFFYDEAAQVKCQQEKPWANDPNYFKRVRISALALLKMVVHARSGGTIEIMGLMQGKTDGDTIIVMDAFALPVEGTETRVNAQADAYEYMVDYSQTNQRAGRLENVVGWYHSHPGYGCWLSGIDVSTQMLNQQYQEPFLAVVIDPTRTISAGKVEIGAFRTYPEGYKPAGEQVSEYQTIPLNKIEDFGVHCKQYYSLDITYFKSSLDSHLLDLLWNKYWVN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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