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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004193`

染色体: Chr03 坐标: 60600602-60602509 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004193`
名称	SmilChr03G004193
描述	probable plastid-lipid-associated protein 8, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60600602 - 60602509 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015070`
GeneID	`131015070`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015070`
原始查询	`SmilChr03G004193`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable plastid-lipid-associated protein 8, chloroplastic
产物	probable plastid-lipid-associated protein 8%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G19940` (AT5G19940) Plastid-lipid associated protein PAP / fibrillin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832116] identity=59.6; qcov=1.01; evalue=7.46e-95; confidence=high
Rice	`Os04g0607000` - identity=70.7; qcov=0.777; evalue=4.4e-89; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04755 (PAP_fibrillin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015070

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057799264.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057799264.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057799264.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799264.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799264.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60600705`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B109,B22,B83
`Chr3:60600705`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B109,B22,B83
`Chr3:60600716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr3:60600725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr3:60600737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B128,C24,C53
`Chr3:60600738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C76
`Chr3:60600764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B49,B85
`Chr3:60600767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr3:60600791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B75,C15
`Chr3:60600806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr3:60601726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B23,B90,B92,C1
`Chr3:60601750`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B112,C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799264.1

233 aa

116

233

PAP_fibrillin

PF04755 PAP_fibrillin 60-226 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799264.1`	Pfam	`PF04755`	PAP_fibrillin	Family	60	226	2.2e-13	51.4	PAP_fibrillin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943281.1
TAAAATTAAAAATAATATACAAAACAAAGCAAAACTACGGCTGCAAAACTTGGAATTATATGGCTGCCATCGCCACTTCTTCTGCTGCAAATGCTGTCGCCAAATTTTCTCTTCCGTTTTCCTCGCCGAGGAATTCGCCGCAGTTCCTTTCTGTTCCACGCCGAGCTCGATCTTCCGCCGGCGTCTGTGCTTCGTTGTCCTCGGCGGCTCCGGTGCTGTCTAAACCCGATGATTTGGTGGAGACCATTCTGTCCAAGGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015070
ATGGCTGCCATCGCCACTTCTTCTGCTGCAAATGCTGTCGCCAAATTTTCTCTTCCGTTTTCCTCGCCGAGGAATTCGCCGCAGTTCCTTTCTGTTCCACGCCGAGCTCGATCTTCCGCCGGCGTCTGTGCTTCGTTGTCCTCGGCGGCTCCGGTGCTGTCTAAACCCGATGATTTGGTGGAGACCATTCTGTCCAAGGTAGTGCAAACAGATAGAGGAGTTCTACTGGCAGGGAGTGAACACCAAAAGGTCGCTGAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799264.1
MAAIATSSAANAVAKFSLPFSSPRNSPQFLSVPRRARSSAGVCASLSSAAPVLSKPDDLVETILSKVVQTDRGVLLAGSEHQKVAEVANELQKFCVSEPVKCPLIFGEWDVVYCSNPTSPGGGYRSAVGRLVFKTKEMVQVVEAPDVVRNQVSFSLFGFIDGEVSLNGKLRALDEKWIQVVFEAPELKVGGLEFRYGGESEVKLQITYVDEKIRLGVGSRGSLFVFQRCTPIS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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