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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004194`

染色体: Chr03 坐标: 60602560-60603252 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004194`
名称	SmilChr03G004194
描述	uncharacterized SmilChr03G004194
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60602560 - 60603252 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019086`
GeneID	`131019086`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019086`
原始查询	`SmilChr03G004194`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0727500; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os02g0727500; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G16810` (AT1G16810) 7-dehydrocholesterol reductase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838252] identity=45.1; qcov=1.14; evalue=5.13e-32; confidence=medium
Rice	`Os02g0727500` - identity=56.2; qcov=1.09; evalue=6.96e-39; confidence=medium
GO	GO:0005730 (nucleolus)
KEGG	-
Pfam	PF08555 (FAM32A)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019086

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803752.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057803752.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803752.1`
4	Nuclear speckle	核斑点	0.40000	`XP_057803752.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057803752.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60602577`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C37
`Chr3:60602577`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C37
`Chr3:60602584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr3:60602616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	A13,A7,B1,B114,B129,B137,B14,B16,B22,B30,B31,B35,B40,B51,B68,B80,B99,C14,C20,C22,C37,C45,C52,C57,C64,C66,C75,C82,C84
`Chr3:60602724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr3:60602727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B108,C23
`Chr3:60602776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:60602777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B56,B96
`Chr3:60602782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B17,C72
`Chr3:60603175`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A11,A23,A4,B106,B112,B114,B117,B120,B122,B16,B24,B33,B6,B69,B70,B72,B78,B85,C13,C48,C63,C79,C8,D4
`Chr3:60603217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr3:60603251`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	73	A13,A2,A4,B1,B105,B11,B110,B113,B120,B122,B126,B136,B18,B2,B23,B25,B27,B28,B38,B39,B42,B43,B44,B45,B49,B50,B58,B63,B64,B68,B7,B70,B72,B79,B8,B84,B89,B90,B91,B92,B93,B97,C1,C10,C11,C17,C20,C28,C29,C31,C35,C37,C38,C41,C44,C47,C5,C51,C56,C59,C6,C67,C69,C7,C74,C76,C77,C80,C83,D10,D11,D2,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803752.1

126 aa

126

FAM32A

PF08555 FAM32A 3-89 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803752.1`	Pfam	`PF08555`	FAM32A	Family	3	89	5.7e-12	47.0	FAM32A

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947769.1
ATGTCAGCTTATGAAAATGTTGTTACTGGCAAGCTGAGGCTGAAGGGTAAAGCTTTGGATGTAAGGAACGCAGCAGGTATCAGAAAGAAAAGGAAGCACAAAGAGCGAAATATCCTATCATATCATGATGCCGGGCACGATCAATTGACAGATGAAAACAACGCGTTGGTATCAGATAGCACATACCCGGATGGAGATGGAGGAGAGGACGAGCGGCTGACTCCAGCAGAAAGACGCTACATGGAACAGCGGCAAAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019086
ATGTCAGCTTATGAAAATGTTGTTACTGGCAAGCTGAGGCTGAAGGGTAAAGCTTTGGATGTAAGGAACGCAGCAGGTATCAGAAAGAAAAGGAAGCACAAAGAGCGAAATATCCTATCATATCATGATGCCGGGCACGATCAATTGACAGATGAAAACAACGCGTTGGTATCAGATAGCACATACCCGGATGGAGATGGAGGAGAGGACGAGCGGCTGACTCCAGCAGAAAGACGCTACATGGAACAGCGGCAAAAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803752.1
MSAYENVVTGKLRLKGKALDVRNAAGIRKKRKHKERNILSYHDAGHDQLTDENNALVSDSTYPDGDGGEDERLTPAERRYMEQRQKIELERLAKAAKKSHRDRIQEFNQYLANLSEHYDIPKVGPG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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