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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004213`

染色体: Chr03 坐标: 60720102-60722559 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004213`
名称	SmilChr03G004213
描述	protein TIC 55, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60720102 - 60722559 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015089`
GeneID	`131015089`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015089`
原始查询	`SmilChr03G004213`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIC 55, chloroplastic-like
产物	protein TIC 55%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G24820` (TIC55-II) translocon at the inner envelope membrane of chloroplasts 55-II [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817019] identity=67; qcov=0.917; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0792800` - identity=66; qcov=0.863; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009507 (chloroplast); GO:0010277 (chlorophyllide a oxygenase activity); GO:0045036 (protein targeting to chloroplast); GO:0051537 (2 iron, 2 sulfur cluster binding)
KEGG	-
Pfam	PF00355 (Rieske); PF08417 (PaO)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015089

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057799306.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057799306.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057799306.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799306.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799306.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60720336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr3:60720402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B7
`Chr3:60720472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:60720498`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B127
`Chr3:60720498`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B127
`Chr3:60720512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B89,C41,D4
`Chr3:60720534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B121,B45,C10,C20
`Chr3:60720603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr3:60720637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr3:60720915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr3:60720970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr3:60720987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B89,C41,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799306.1

539 aa

270

539

Rieske

PaO

PF00355 Rieske 83-165 aa PF08417 PaO 292-378 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799306.1`	Pfam	`PF00355`	Rieske	Domain	83	165	3.5e-25	88.4	Rieske [2Fe-2S] domain
`XP_057799306.1`	Pfam	`PF08417`	PaO	Family	292	378	1.3e-21	77.2	Pheophorbide a oxygenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943323.1
ATACAAAACTTTTAGAACTGAGCATAATTGGAAAATGTCCGAATAGAGTTAGTTATTGTGCGGCCAGAACTCATTTTCTTCAAAGCTTATTTCCGTTTTCAACCAACCAAACCAAAACCTCCAATTTTGGAAGCTGAAAACAATGGCTCTCTTACGATTACAATCAATTTCCACCCTCACATTTCCATCACTACCACTAAAACCCTCAAAATCAAGAATCGCATTCTGTAGCCGACGACCCTTAAACCCCTGCCAGCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015089
ATGGCTCTCTTACGATTACAATCAATTTCCACCCTCACATTTCCATCACTACCACTAAAACCCTCAAAATCAAGAATCGCATTCTGTAGCCGACGACCCTTAAACCCCTGCCAGCATCATCAACTGCAGAAACACCAGCAGAAATTGAGTGCAGTTGCCGGAGAAATCTCAGCGGCGGAGGGCGATCAGAGCGTGATTGAAGACTCTCTGAGGCAGAACGAAGTAGTGAGGTATGAGTGGAGTGAAGAATGGTACCCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799306.1
MALLRLQSISTLTFPSLPLKPSKSRIAFCSRRPLNPCQHHQLQKHQQKLSAVAGEISAAEGDQSVIEDSLRQNEVVRYEWSEEWYPLYLTNNVPDDAPLGLTVFDKQVVLFRDGGGEIRCYEDRCPHRLAKLSEGQLIDGRLECLYHGWQFEGNGKCVKVPQLSEGAKIPASACVRTYEIKDSQGVIWIWMSRKTPPNLAKIPWFENFERPGFRDLSTIHELPYDHSILLENLMDPAHVPISHNRSDSTSKREEAGPLYF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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