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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004214`

染色体: Chr03 坐标: 60723482-60726746 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004214`
名称	SmilChr03G004214
描述	uncharacterized SmilChr03G004214
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60723482 - 60726746 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015094`
GeneID	`131015094`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015094`
原始查询	`SmilChr03G004214`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07741 (BRF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015094

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799323.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057799323.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799323.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799323.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799323.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60723647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B9,B99,C43,C7
`Chr3:60723675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B77
`Chr3:60723684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:60723746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr3:60723751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C83
`Chr3:60723776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr3:60723780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B9,B99,C43,C7
`Chr3:60723781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr3:60724290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C42
`Chr3:60724308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B7,B71
`Chr3:60724324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr3:60724913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799323.1

227 aa

114

227

BRF1

PF07741 BRF1 87-177 aa

XP_057799324.1

226 aa

113

226

BRF1

PF07741 BRF1 86-176 aa

XP_057799325.1

226 aa

113

226

BRF1

PF07741 BRF1 87-177 aa

XP_057799326.1

222 aa

111

222

BRF1

PF07741 BRF1 82-172 aa

XP_057799328.1

213 aa

106

213

BRF1

PF07741 BRF1 73-164 aa

XP_057799329.1

212 aa

106

212

BRF1

PF07741 BRF1 73-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799323.1`	Pfam	`PF07741`	BRF1	Domain	87	177	4.5e-06	27.6	Brf1-like TBP-binding domain
`XP_057799324.1`	Pfam	`PF07741`	BRF1	Domain	86	176	4.6e-06	27.6	Brf1-like TBP-binding domain
`XP_057799325.1`	Pfam	`PF07741`	BRF1	Domain	87	177	3.7e-06	27.9	Brf1-like TBP-binding domain
`XP_057799326.1`	Pfam	`PF07741`	BRF1	Domain	82	172	4.4e-06	27.6	Brf1-like TBP-binding domain
`XP_057799328.1`	Pfam	`PF07741`	BRF1	Domain	73	164	4.9e-06	27.5	Brf1-like TBP-binding domain
`XP_057799329.1`	Pfam	`PF07741`	BRF1	Domain	73	164	2.9e-06	28.2	Brf1-like TBP-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943346.1
GGAGGGTATTTCTGTAATAAACCATAGAACACAGAAGTAAATAAACCAGCTGCAGCTTCAAGGGTTCGCATCTTCAAGCTTCCGCGATAGCTGCAATGGCGGTTACGCAAGAGTCCGACGGCAAGTCGAAAGAAACGGTGGAAGAACCAATTCAACATTGTGGCGGAGAAGGTGCAGATCCAGGTTCATGTCCACTCAGTCAACGTAGAAAACATGATGGTCCTTCAGCTAGACACAAGGGTATAGGGAAGGATATTTCT...

XM_057943345.1
GGAGGGTATTTCTGTAATAAACCATAGAACACAGAAGTAAATAAACCAGCTGCAGCTTCAAGGGTTCGCATCTTCAAGCTTCCGCGATAGCTGCAATGGCGGTTACGCAAGAGTCCGACGGCAAGTCGAAAGAAACGGTGGAAGAACCAATTCAACATTGTGGCGGAGAAGGTGCAGATCCAGGTTCATGTCCACTCAGTCAACGTAGAAAACATGATGGTCCTTCAGCTAGACACAAGGGTATAGGGAAGGATATTTCT...

CDS

6 records

下载 CDS FASTA

LOC131015094
ATGGCGGTTACGCAAGAGTCCGACGGCAAGTCGAAAGAAACGGTGGAAGAACCAATTCAACATTGTGGCGGAGAAGGTGCAGATCCAGGTTCATGTCCACTCAGTCAACGTAGAAAACATGATGGTCCTTCAGCTAGACACAAGGGTATAGGGAAGGATATTTCTGGAGTTGTAAGAAGTCACAACCAAGGCAGAAAATCAAATAGACTATCTGTTGTTGATGATATTGAGGTTGTTGGATACCTTAATACCAAAGAGGA...

Protein

6 records

下载 Protein FASTA

XP_057799323.1
MASCLDHVVDFLYGGLVCKKPCNLSLKLVEEPIQHCGGEGADPGSCPLSQRRKHDGPSARHKGIGKDISGVVRSHNQGRKSNRLSVVDDIEVVGYLNTKEEIHRKRILWEAMNENHTKAKKQKRAAETKKGVAVKKVTKTTEKVEPKSHGSRINDDALKFLRGDLQESCESGEATMADSCAQNSPKRGSKESWYEEDQSDNDTFGGDEEDEMHYQYRDDHFYDDFDS

XP_057799324.1
MASCLDHVVDFLYGGLVCKKPCRSFFQVEEPIQHCGGEGADPGSCPLSQRRKHDGPSARHKGIGKDISGVVRSHNQGRKSNRLSVVDDIEVVGYLNTKEEIHRKRILWEAMNENHTKAKKQKRAAETKKGVAVKKVTKTTEKVEPKSHGSRINDDALKFLRGDLQESCESGEATMADSCAQNSPKRGSKESWYEEDQSDNDTFGGDEEDEMHYQYRDDHFYDDFDS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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