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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004221`

染色体: Chr03 坐标: 60774637-60778588 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004221`
名称	SmilChr03G004221
描述	probable monogalactosyldiacylglycerol synthase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60774637 - 60778588 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015096`
GeneID	`131015096`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015096`
原始查询	`SmilChr03G004221`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable monogalactosyldiacylglycerol synthase, chloroplastic
产物	probable monogalactosyldiacylglycerol synthase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G31780` (MGD1) monogalactosyl diacylglycerol synthase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829306] identity=72; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0423600` (MGD1) - identity=74.2; qcov=0.898; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009247 (glycolipid biosynthetic process); GO:0016758 (hexosyltransferase activity)
KEGG	smil00561 (Glycerolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04101 (Glyco_tran_28_C); PF06925 (MGDG_synth)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015096

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057799331.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057799331.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799331.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799331.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799331.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60775220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr3:60775360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,C10,C20
`Chr3:60775505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr3:60775562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr3:60775985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B14
`Chr3:60775994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr3:60776033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B23,C17,D11
`Chr3:60777481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr3:60777501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr3:60777907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B14
`Chr3:60778264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B23,C17
`Chr3:60778296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799331.1

519 aa

260

519

MGDG_synth

Glyco_tran_28_C

PF06925 MGDG_synth 142-310 aa PF04101 Glyco_tran_28_C 369-454 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799331.1`	Pfam	`PF06925`	MGDG_synth	Family	142	310	4.6e-62	209.8	Monogalactosyldiacylglycerol (MGDG) synthase
`XP_057799331.1`	Pfam	`PF04101`	Glyco_tran_28_C	Domain	369	454	8.2e-10	39.7	Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943348.1
TCCCTCTCTCTCTCTCTCACACACACGCGCGCGCGCTCCACCTCATCTATTTCATTTTTGTTTTTGCTTGTTTTTATTGTCTGCTGCAACGAGTTGATATCGCGTCTGATGTGGGCATATATCTCAAGGAGGATCAAATTGAATTCCTTTGGTATATTATTCCTCAAAAGTGTATATATATATTTGGGATATATTACGTCCCTTCACTAAATCCTATCTCTGTGGTTGCAATTCCTCTCCAAATTCCCACCTTCTTTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015096
ATGCAGCCTTCGACTGTGAACAAAGAATCCGCAAACCCCTTTGGTTTCGTTTCTCAGTTGGGCAATTTAGTGCTCGATTCCTCGAGGCTGAATCCCGATGGGCACGCCACGTGTTTGTCCAATTACTTGTACTTCGATGAGAGGAAGAAGAAGCCCGGGGCTGTGGCTTCATTGGCCCTGAGTTCTAAAGGCGCTGCCTTTAACATTAGGAGAGCGATGAATCAGCTCAATAGTGCAATTAGGTTCCACTGCGAGAGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799331.1
MQPSTVNKESANPFGFVSQLGNLVLDSSRLNPDGHATCLSNYLYFDERKKKPGAVASLALSSKGAAFNIRRAMNQLNSAIRFHCERIPLSFASVHVDAGESNGCGDDGNGVLEESERNPADAVVSDSPKNVLILMSDTGGGHRASAEAIKAAFAEEFGDEYQVFVTDLWTDHTPWPFNQLPKSYNFLVKHGTLWKMTYYASAPRLIHRTNFAATSTFIAREVAKGLMKYKPDIIISVHPLMQHVPLRILRSKGLLKKIVF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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