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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004226`

染色体: Chr03 坐标: 60802707-60805033 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004226`
名称	SmilChr03G004226
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60802707 - 60805033 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015101`
GeneID	`131015101`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015101`
原始查询	`SmilChr03G004226`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
产物	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
Arabidopsis	`AT3G26922` (AT3G26922) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922367] identity=31.4; qcov=0.556; evalue=1.65e-24; confidence=low
Rice	`Os08g0461000` (OsFbox451) - identity=25.9; qcov=0.488; evalue=4.73e-13; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015101

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799335.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799335.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799335.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799335.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799335.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60802917`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	30	A23,A4,A6,B102,B105,B112,B118,B128,B13,B139,B25,B28,B31,B33,B41,B42,B43,B58,B70,B88,B94,C24,C29,C34,C35,C39,C46,C49,C60,C61
`Chr3:60803005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C44
`Chr3:60803079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,C19,C4,D11
`Chr3:60803167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr3:60803174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr3:60803499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr3:60803508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,A4,C39
`Chr3:60803531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B51,B64,C46,C87
`Chr3:60803579`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B122,B28,C31,C47
`Chr3:60803579`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B122,B28,C31,C47
`Chr3:60803859`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B111,B23,C40,C64,C66,C74,C80,D11
`Chr3:60803862`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B111,B23,C40,C64,C66,C74,C80,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799335.1

459 aa

230

459

F-box

F-box-like

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 19-57 aa PF12937 F-box-like 20-52 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 82-420 aa PF24758 LRR_At5g56370 99-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799335.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	19	57	2.2e-07	31.2	F-box domain
`XP_057799335.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	20	52	4.8e-06	27.0	F-box-like
`XP_057799335.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	82	420	1.1e-08	35.6	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057799335.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	99	216	2.8e-13	50.8	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943352.1
GATCCCTCTCTCTACGTTTCTCTCGCTCTTCTTCATAGCGCCATAAACCCTTCTTCATCTTCTCAATGGCTCGTTAATTCTCTCGTTCCTAAATATGCAATTCTCTCGCCCCTCTGCCTTTTTTCCGTAAATTCCGGCGAAGATACTCATTGACAGTAGGGTTTCACTTTTGTCTTGATCGAAAATTATTTTCGTGAAGCTGATCTTCCCACCACCACTATACATTTAATCCCAAGAATCCGCTTCAAAGAATCCGATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015101
ATGGATGAATGGGAAGATTACGGAACTGCAGAAGCAAACAGCGGTCGAGATCGACTCAGTGAGTTACCCGACTCTTTAATTCTTTCAATCCTTTCATTGTTGGATATGAGAGATGTTGTTCGGACAAGCATTTTCTCAAAACGTTGGAGATATCTCTGGTCCACCATCCCCTGCCTCGAATTCTTCGAACAAACTTCAAGTACTATTTCTCGTGTTCTTTCACAATGGAAATGCCCTAAGATTCTGAAATTCCAATTATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799335.1
MDEWEDYGTAEANSGRDRLSELPDSLILSILSLLDMRDVVRTSIFSKRWRYLWSTIPCLEFFEQTSSTISRVLSQWKCPKILKFQLSFGNFTEGLSIDVDSWLLFVIEKQVGEFFLDFFNSDHKYRLPQALYSCSSITKLTLEDCTLRIEENVQWNQLKILKLGYLNWLSGDAINQILLGAPRLEELVLEYILYDIGENENFNIRSTSLKMLNIIVDHDARWPETAVLRIWAPNLLTFNIEASLYCTCLLDVPSLTHAIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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