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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004230`

染色体: Chr03 坐标: 60839524-60846564 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004230`
名称	SmilChr03G004230
描述	copalyl diphosphate synthase 2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60839524 - 60846564 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015105`
GeneID	`131015105`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015105`
原始查询	`SmilChr03G004230`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	copalyl diphosphate synthase 2, chloroplastic-like
产物	copalyl diphosphate synthase 2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G02780` (GA1) Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828182] identity=42.2; qcov=0.935; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os02g0278700` (OsCPS1) - identity=40.9; qcov=0.937; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009686 (gibberellin biosynthetic process); GO:0010333 (terpene synthase activity)
KEGG	smil00904 (Diterpenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01397 (Terpene_synth)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015105

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057799339.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057799339.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057799339.1`
4	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057799339.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799339.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60839675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B90,B92,C87,D10
`Chr3:60839679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr3:60839695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr3:60839704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B67,B88,C40
`Chr3:60839709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C12
`Chr3:60839727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,D10
`Chr3:60839877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:60840509`	`CT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B13,C58
`Chr3:60840663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr3:60840705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr3:60840756`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	42	A22,A23,A4,A6,B102,B105,B11,B112,B115,B118,B121,B128,B13,B139,B25,B28,B31,B33,B41,B42,B43,B58,B59,B69,B70,B88,B94,B98,C22,C24,C29,C34,C35,C39,C46,C49,C53,C60,C61,C65,C71,C82
`Chr3:60840758`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	42	A22,A23,A4,A6,B102,B105,B11,B112,B115,B118,B121,B128,B13,B139,B25,B28,B31,B33,B41,B42,B43,B58,B59,B69,B70,B88,B94,B98,C22,C24,C29,C34,C35,C39,C46,C49,C53,C60,C61,C65,C71,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799339.1

798 aa

399

798

Terpene_synth

PF01397 Terpene_synth 268-468 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799339.1`	Pfam	`PF01397`	Terpene_synth	Repeat	268	468	3.9e-43	148.1	Terpene synthase, N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943356.1
TCTATATATATTGATTCCCTTTGACTGCTGGAAACACTAAAATTTTCCTTCCAGATTAATTATTTCAATTTCCCTCCAAAACTCGGGGAAAATTGAAAAATTAAGAAAATGACCTCTTTGTTCAGTCTAAATTTGAGCAGAGCACCGGCTACCCGCCGCAGGTTACAGCTACCGGCAGAGGTTCACCTGTCGGAATTTTTCGCCGTCTATGCATGGCTGAATAGTAGCACCAAACCCTCGCCCTTGACTTTCCAAATTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015105
ATGACCTCTTTGTTCAGTCTAAATTTGAGCAGAGCACCGGCTACCCGCCGCAGGTTACAGCTACCGGCAGAGGTTCACCTGTCGGAATTTTTCGCCGTCTATGCATGGCTGAATAGTAGCACCAAACCCTCGCCCTTGACTTTCCAAATTCAACGCAAGCACCTGTCGAAAGTAACCGAATGTCGAGTAGCAAGTCTGGATGGGGTACAAGTGAGTGAAAAAGACACTCCTCTTCGAACTCCCAATGAGATCAACAAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799339.1
MTSLFSLNLSRAPATRRRLQLPAEVHLSEFFAVYAWLNSSTKPSPLTFQIQRKHLSKVTECRVASLDGVQVSEKDTPLRTPNEINKKIEDSIEYVKNLLMTSGDGRISVSPYDTSIAALIKDVKGRNAPQFPSCLEWIAQHQMADGSWGDEFFCIYDRIVNTLACVIALKSWNVHAHMIQKGVAYVNENVHKLKDGNLEHMTSGFEIVVPALVQRAKDLGIQGLPYDHPLINEIAITKEGRLKKIPKEMIYQTPTTLLFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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