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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004233`

染色体: Chr03 坐标: 60855138-60858298 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004233`
名称	SmilChr03G004233
描述	uncharacterized SmilChr03G004233
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60855138 - 60858298 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019093`
GeneID	`131019093`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019093`
原始查询	`SmilChr03G004233`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0460733; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os10g0460733; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=32.4; qcov=0.903; evalue=2.59e-44; confidence=low
Rice	`Os10g0460733` - identity=40.5; qcov=0.715; evalue=5.02e-59; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019093

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803759.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057803759.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057803759.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057803759.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803759.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60855405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B23,B75,C58
`Chr3:60855437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A6,B139,C18,C44
`Chr3:60855440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:60855471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,C24,C32,C68
`Chr3:60855474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr3:60855493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,A16,B123,B70,C28
`Chr3:60855552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	A10,A11,B101,B128,B139,B14,B15,B23,B4,B54,B65,B8,B90,B92,B93,C16,C27,C35,C36,C43,C46,C54,C58,C6,C62,C64,C66,C71,C86,D2
`Chr3:60855579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr3:60855591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B136
`Chr3:60855591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr3:60855643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:60855702`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803759.1

362 aa

181

362

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

Plant_tran

PF01609 DDE_Tnp_1 132-299 aa PF13359 DDE_Tnp_4 139-299 aa PF04827 Plant_tran 245-302 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803759.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	132	299	2e-10	41.5	Transposase DDE domain
`XP_057803759.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	139	299	3.7e-23	82.6	DDE superfamily endonuclease
`XP_057803759.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	245	302	2.1e-06	28.3	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947776.1
ATGCAAGGTTATCTCGTCGCCGGCAACGGAAAGATTAGAAATTTGGGTCGCCGGCCTCGTTGTCCTCGTCGTAGGCTCGAGCAGCATCTGGGAAAGAAGGGTTATCTCGTCGCCGGCAACGGAAAGATTAGAAATTTGGGTCGCCGGCCTCGTTGTCCTCGTCGTAGGCTCGAGCAGCATCTGGAAAAGAAGATTTCAACTCTTTTGCTGATTTCCCTCTCTGGTGCTTTTCGCGGCGGCGACAACAGGCTTCGGTCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019093
ATGCAAGGTTATCTCGTCGCCGGCAACGGAAAGATTAGAAATTTGGGTCGCCGGCCTCGTTGTCCTCGTCGTAGGCTCGAGCAGCATCTGGGAAAGAAGGGTTATCTCGTCGCCGGCAACGGAAAGATTAGAAATTTGGGTCGCCGGCCTCGTTGTCCTCGTCGTAGGCTCGAGCAGCATCTGGAAAAGAAGATTTCAACTCTTTTGCTGATTTCCCTCTCTGGTGCTTTTCGCGGCGGCGACAACAGGCTTCGGTCGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803759.1
MQGYLVAGNGKIRNLGRRPRCPRRRLEQHLGKKGYLVAGNGKIRNLGRRPRCPRRRLEQHLEKKISTLLLISLSGAFRGGDNRLRSISKTFSSLWACESSCISGAIIRLHDLFLSKPEAVPADCSDPRWRWFKGCLGALDGTYVSVTVGNEDKPRYRTRKGQISTNVLGVCDRHCNFSYVLAGWEGSAADSRVLRDAIRRPHGLKVPRGKYYLCDNGYANSEGFLTPFKGVRYHLKEWGPNNARPQNKEELFNLRHSKAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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