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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004252`

染色体: Chr03 坐标: 60995335-61000124 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004252`
名称	SmilChr03G004252
描述	patatin-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60995335 - 61000124 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015128`
GeneID	`131015128`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015128`
原始查询	`SmilChr03G004252`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	patatin-like protein 2
产物	patatin-like protein 2
Arabidopsis	`AT2G26560` (PLA2A) phospholipase A 2A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817197] identity=58.7; qcov=0.995; evalue=6.48e-160; confidence=high
Rice	`Os08g0477100` (OspPLAIIepsilon) - identity=55.8; qcov=0.997; evalue=4.22e-155; confidence=high
GO	GO:0004620 (glycerophospholipase activity); GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0047372 (monoacylglycerol lipase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01734 (Patatin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015128

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799365.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057799365.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799365.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799365.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799365.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60995514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,C44,C77
`Chr3:60995532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B2,B24,C25,C8
`Chr3:60995618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,B82
`Chr3:60995688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B120,B76
`Chr3:60996160`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A21,B127,B134,B34,B70,C19,C48,C60
`Chr3:60996194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C54
`Chr3:60996290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B2,B24,C25,C8
`Chr3:60996560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr3:60996617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C54
`Chr3:60996620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:60999297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C71,C81
`Chr3:60999357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799365.1

413 aa

206

413

Patatin

PF01734 Patatin 21-237 aa

XP_057799366.1

397 aa

198

397

Patatin

PF01734 Patatin 21-221 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799365.1`	Pfam	`PF01734`	Patatin	Domain	21	237	1.1e-27	98.2	Patatin-like phospholipase
`XP_057799366.1`	Pfam	`PF01734`	Patatin	Domain	21	221	2.7e-29	103.4	Patatin-like phospholipase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943382.1
TTCTTCATCCTTTTCATCATCTTCATAATCTACAACATAAATTGATTGTTACGTTATAATTTGTCATCTCCCATGACTACATCTTCCTCGAAGAAACTCCGAGCTCCAATTAATGGAAGACTAGTCACTATTCTGAGCATCGATGGAGGAGGCATTCGAGGAATCATCCCCGCCAAGATCCTCGAATTCCTCGAATCCGAACTCCAGAAATTGGACGGCGACGATGCAAGAATTGCAGACTACTTCGACGTGGTCGCGGG...

XM_057943383.1
TCATCCTTTTCATCATCTTCATAATCTACAACATAAATTGATTGTTACGTTATAATTTGTCATCTCCCATGACTACATCTTCCTCGAAGAAACTCCGAGCTCCAATTAATGGAAGACTAGTCACTATTCTGAGCATCGATGGAGGAGGCATTCGAGGAATCATCCCCGCCAAGATCCTCGAATTCCTCGAATCCGAACTCCAGAAATTGGACGGCGACGATGCAAGAATTGCAGACTACTTCGACGTGGTCGCGGGGACG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015128
ATGACTACATCTTCCTCGAAGAAACTCCGAGCTCCAATTAATGGAAGACTAGTCACTATTCTGAGCATCGATGGAGGAGGCATTCGAGGAATCATCCCCGCCAAGATCCTCGAATTCCTCGAATCCGAACTCCAGAAATTGGACGGCGACGATGCAAGAATTGCAGACTACTTCGACGTGGTCGCGGGGACGAGCACCGGAGGGCTGGTGACGGCCATGCTGACGGCTCCTGATGCTGAAAACCGCCCCTTGTTCGCTGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799365.1
MTTSSSKKLRAPINGRLVTILSIDGGGIRGIIPAKILEFLESELQKLDGDDARIADYFDVVAGTSTGGLVTAMLTAPDAENRPLFAAKDIAPFYVQNGLKIFPKRSCKKIWMKWDCCLSCSGLLGSVGALVGPKYDGEYLRKLLRDALGQTRLHHTLTKVVIPTFDIKNMQPTIFSSYEVKNVGYKNALLSDICIATSAAPTYFPPHHFTDTDDSGHSWDFNLIDGGVAANNPTLVAVREVTKEVVRGSEDFFPIQPLDC...

XP_057799366.1
MTTSSSKKLRAPINGRLVTILSIDGGGIRGIIPAKILEFLESELQKLDGDDARIADYFDVVAGTSTGGLVTAMLTAPDAENRPLFAAKDIAPFYVQNGLKIFPKSGLLGSVGALVGPKYDGEYLRKLLRDALGQTRLHHTLTKVVIPTFDIKNMQPTIFSSYEVKNVGYKNALLSDICIATSAAPTYFPPHHFTDTDDSGHSWDFNLIDGGVAANNPTLVAVREVTKEVVRGSEDFFPIQPLDCTKLLVISLGTGNAKRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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