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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004255`

染色体: Chr03 坐标: 61037926-61042098 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004255`
名称	SmilChr03G004255
描述	BTB/POZ domain-containing protein NPY1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61037926 - 61042098 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015132`
GeneID	`131015132`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015132`
原始查询	`SmilChr03G004255`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ domain-containing protein NPY1
产物	BTB/POZ domain-containing protein NPY1
Arabidopsis	`AT4G31820` (ENP) Phototropic-responsive NPH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829311] identity=54.9; qcov=0.95; evalue=3.52e-164; confidence=high
Rice	`Os09g0420900` - identity=51.8; qcov=1.06; evalue=2.01e-174; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00651 (BTB); PF03000 (NPH3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015132

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799371.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057799371.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057799371.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799371.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799371.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61040334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B46,B48,B93,C56
`Chr3:61040706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B85
`Chr3:61040790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,C23,C42
`Chr3:61040889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B51,B81,C13,D8
`Chr3:61041021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:61041027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B101,B126,B33,B87
`Chr3:61041112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr3:61041156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B40,C87
`Chr3:61041256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B68,C43
`Chr3:61041258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B65,B77
`Chr3:61041273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B48,B93,C56
`Chr3:61041324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B48,B93,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799371.1

594 aa

297

594

BTB

NPH3

PF00651 BTB 26-117 aa PF03000 NPH3 211-460 aa

XP_057799372.1

483 aa

242

483

NPH3

PF03000 NPH3 100-349 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799371.1`	Pfam	`PF00651`	BTB	Domain	26	117	8.5e-06	26.6	BTB/POZ domain
`XP_057799371.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	211	460	1.3e-83	281.3	NPH3 family
`XP_057799372.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	100	349	7.8e-84	282.1	NPH3 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943388.1
GGTTGGCGTGCATTAACGGCACAAAGCTTGAAAAAGGAGTAGTGTAGTGTGCACCCTCTGTTCCACTCTGTCAAAGACAGTAGAAACCCCCCCACTTACTCTTATACTACGCCACCCCACACGTACTCTCCCTCTCCCTCTCTCTCTTCAGAAAGAGGAACCAGAGCGACAACTCCTTCAGTATATTCAGTCCCTCCTCGGCTCCACACCGAATACACGCATTTCGCATTCATTTACATGTAGGAGAGAGAGGGTCTTGA...

XM_057943389.1
GATTGTATTAATTCATATTTGGCTGCCATTATGTGCCTCATTCGAGAAGAAACATAAGTTGTGAAATTTAGAACTTGTACAGAAGTATGTGTCGTCTGAATTGGCAACTGATGCCATCATAAGCGTTGGCGATGTGAAGTTCCTTCTCCATAAGTTTCCTCTCTTGTCCAAGAGCAATAAGTTGCAGAAGCTCGTATCAGGAGGGAGCGAGGAAAGCCCTGATGAGATCCGGTTGGTTGATTTCCCCGGTGGCCCTAAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015132
ATGAAGTATATGAAGCTGGGGTCGAAGCCAGATGCTTTTCAAGCTGAAGGGAATTGTGTGAGGTATGTGTCGTCTGAATTGGCAACTGATGCCATCATAAGCGTTGGCGATGTGAAGTTCCTTCTCCATAAGTTTCCTCTCTTGTCCAAGAGCAATAAGTTGCAGAAGCTCGTATCAGGAGGGAGCGAGGAAAGCCCTGATGAGATCCGGTTGGTTGATTTCCCCGGTGGCCCTAAAGCATTTGAGATATGTGCCAAGTT...

LOC131015132
ATGACTGAGGATATCGACAGAGGAAACCTGATCTTGAAGATCGACATATTCCTCAACTCCAGTGTTCTGCGCAACTGGAAGGATTCCATCATCGTCCTACAGACCTCCAAGTCTCTCCTCCCGTGGTCCGAGAATCTAAAGATAGTCGGCAGGTGCATAGATTCAATAGCATCCAAAACGTCTGTGGATCCTTCGGTCATCACCTGGTCTTACACTTATAACAGAAGACTGGCCACATCAGACCAAATAATCCACAGTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799371.1
MKYMKLGSKPDAFQAEGNCVRYVSSELATDAIISVGDVKFLLHKFPLLSKSNKLQKLVSGGSEESPDEIRLVDFPGGPKAFEICAKFCYGVTVTLNPYNVVAARCAAEYLEMTEDIDRGNLILKIDIFLNSSVLRNWKDSIIVLQTSKSLLPWSENLKIVGRCIDSIASKTSVDPSVITWSYTYNRRLATSDQIIHSGLKFSEKMETVPKDWWIEDICELDIDLYKRVMLAIKSKGRMGGGVIGEALKAYAMRWLPDSVD...

XP_057799372.1
MTEDIDRGNLILKIDIFLNSSVLRNWKDSIIVLQTSKSLLPWSENLKIVGRCIDSIASKTSVDPSVITWSYTYNRRLATSDQIIHSGLKFSEKMETVPKDWWIEDICELDIDLYKRVMLAIKSKGRMGGGVIGEALKAYAMRWLPDSVDALVSEVHINRNKSLVETIICLLPSDKGISCACSFLLKLLKVAILIEADDSSREELIKNISLKLDDASVGDLLIPARPPQTTLYDVELVQRLVDLFVENQMSKKDKRVIEKN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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