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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004270`

染色体: Chr03 坐标: 61166084-61168137 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004270`
名称	SmilChr03G004270
描述	DNA cross-link repair protein SNM1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61166084 - 61168137 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019096`
GeneID	`131019096`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019096`
原始查询	`SmilChr03G004270`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA cross-link repair protein SNM1-like
产物	DNA cross-link repair protein SNM1-like
Arabidopsis	`AT2G45700` (AT2G45700) sterile alpha motif (SAM) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819178] identity=55.9; qcov=1.04; evalue=1.62e-66; confidence=high
Rice	`Os09g0439000` - identity=57.4; qcov=1.02; evalue=4.68e-65; confidence=high
GO	GO:0003684 (damaged DNA binding); GO:0006303 (double-strand break repair via nonhomologous end joining); GO:0031848 (protection from non-homologous end joining at telomere); GO:0035312 (5'-3' DNA exonuclease activity); GO:0036297 (interstrand cross-link repair)
KEGG	-
Pfam	PF07522 (DRMBL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019096

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803761.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803761.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057803761.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803761.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803761.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61166109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B27,C38,C76
`Chr3:61166126`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B138
`Chr3:61166126`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B138
`Chr3:61166160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,D10
`Chr3:61166176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,D10
`Chr3:61166205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C27
`Chr3:61166325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C52
`Chr3:61166326`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A10,A15,A8,B113,B119,B17,B57,B64,B65,B87,B9,B98,C42,C50,C53,C58,C6,C85
`Chr3:61166343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:61166380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:61166388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B101,B126,B33
`Chr3:61166395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803761.1

179 aa

179

DRMBL

PF07522 DRMBL 66-165 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803761.1`	Pfam	`PF07522`	DRMBL	Domain	66	165	1.5e-12	48.3	DNA repair metallo-beta-lactamase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947778.1
ATGAAGGAGGCCATAATCCAGTTTGTAATTGATGCCATCCGAGCTGAAGCTTTCAACCCAAAGACCCTGTTTCTGATTGGCGGCCATACCATTGGGAAAGAAAGGGTGTTTGTAGAGGTTGCTAGAGCACTCCACGAGAAAGCCTATGTCACTGCTGCAAAACTACGCATCTTGGAATGTCTTGGTTTTGCACAGGAAGATATGCAATGGTTTACCAAAAATGCACATGAGAGCCACATTCGCATCGTTCCCATGTGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019096
ATGAAGGAGGCCATAATCCAGTTTGTAATTGATGCCATCCGAGCTGAAGCTTTCAACCCAAAGACCCTGTTTCTGATTGGCGGCCATACCATTGGGAAAGAAAGGGTGTTTGTAGAGGTTGCTAGAGCACTCCACGAGAAAGCCTATGTCACTGCTGCAAAACTACGCATCTTGGAATGTCTTGGTTTTGCACAGGAAGATATGCAATGGTTTACCAAAAATGCACATGAGAGCCACATTCGCATCGTTCCCATGTGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803761.1
MKEAIIQFVIDAIRAEAFNPKTLFLIGGHTIGKERVFVEVARALHEKAYVTAAKLRILECLGFAQEDMQWFTKNAHESHIRIVPMWSIASFKRLDHMSKHYMGRFSLMVAFFAYLLAVWQRKEVDWKKVAEGCEVPYSKRSSFTELKEFVKFASPANIFPSVNNHSPDSQNSMVSQLLS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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