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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004279`

染色体: Chr03 坐标: 61227793-61229177 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004279`
名称	SmilChr03G004279
描述	U-box domain-containing protein 39-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61227793 - 61229177 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015159`
GeneID	`131015159`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015159`
原始查询	`SmilChr03G004279`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 39-like
产物	U-box domain-containing protein 39-like
Arabidopsis	`AT3G46510` (PUB13) plant U-box 13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823804] identity=27.4; qcov=0.922; evalue=1.34e-17; confidence=low
Rice	`Os08g0110500` (PUB15) - identity=30.2; qcov=0.846; evalue=5.09e-18; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF25598 (ARM_PUB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015159

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799413.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057799413.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057799413.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799413.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799413.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61227958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,A9,B137,B80,C74
`Chr3:61227988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B24,B97,C27,C55
`Chr3:61228002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C37
`Chr3:61228171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:61228235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr3:61228261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr3:61228849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr3:61228906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr3:61228995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr3:61229033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799413.1

293 aa

146

293

ARM_PUB

PF25598 ARM_PUB 12-288 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799413.1`	Pfam	`PF25598`	ARM_PUB	Repeat	12	288	8.4e-14	52.4	Plant U-box protein ARM repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943430.1
ATAATTTAGTGATGATGGCAAACCGAGTTCGTGAAACCATCGTGGAATGCATGAGAGTAGCTCAATCCTCCGGCGGCGACGAGGAGGATCGGTGCGAGGCGCTGCAAACCCTAGCCACCATCACCAAGATCAGCCCTCAAAATCGGAACCTGGTGGCACAAGTCGACGGCGCCGTCGCCTCGCTTCTCGCCCTCTCCAAATCGCCTCAACATCGGCTCCAAGCTCTGGCGCTCTCGGTGCTCTTCAATCTCTCCCTCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015159
ATGATGGCAAACCGAGTTCGTGAAACCATCGTGGAATGCATGAGAGTAGCTCAATCCTCCGGCGGCGACGAGGAGGATCGGTGCGAGGCGCTGCAAACCCTAGCCACCATCACCAAGATCAGCCCTCAAAATCGGAACCTGGTGGCACAAGTCGACGGCGCCGTCGCCTCGCTTCTCGCCCTCTCCAAATCGCCTCAACATCGGCTCCAAGCTCTGGCGCTCTCGGTGCTCTTCAATCTCTCCCTCAACCCCAACTTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799413.1
MMANRVRETIVECMRVAQSSGGDEEDRCEALQTLATITKISPQNRNLVAQVDGAVASLLALSKSPQHRLQALALSVLFNLSLNPNFKHSLAQRDTIFHLTSLIHSPESAKLAASFLCSLAMLDKNKAKFGVAGTVEVLVKAVSGPCGPATHHLLSSLAELVQFHGNCTLAVRAGAVPAVMTLAESGDGEELAGIALAILGLLARFEEGLSELKRTERIVARMVVILKSGCFLSKEGAAEILLRLFDDSEKLLRDAAELPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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