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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004285`

染色体: Chr03 坐标: 61267817-61269613 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004285`
名称	SmilChr03G004285
描述	cytochrome P450 71D95-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61267817 - 61269613 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015163`
GeneID	`131015163`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015163`
原始查询	`SmilChr03G004285`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome P450 71D95-like
产物	cytochrome P450 71D95-like
Arabidopsis	`AT3G26300` (CYP71B34) cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 34 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822234] identity=41.5; qcov=0.994; evalue=3.96e-138; confidence=medium
Rice	`Os03g0593600` (CYP71W1) - identity=46.8; qcov=0.966; evalue=3.44e-151; confidence=high
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	smil00909 (Sesquiterpenoid and triterpenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015163

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057799417.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057799417.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799417.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799417.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799417.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61267891`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A8
`Chr3:61267891`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A8
`Chr3:61267949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr3:61267983`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A18
`Chr3:61267983`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A18
`Chr3:61267991`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	22	A16,A7,B12,B13,B2,B3,B31,B62,B65,B7,B84,C1,C41,C45,C46,C60,C62,C63,C65,C71,C74,C80
`Chr3:61268036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:61268177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,C76
`Chr3:61268198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr3:61268243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B45,C7,C74
`Chr3:61268246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B71,C16,C54,C82
`Chr3:61268303`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A14,B22,B52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799417.1

502 aa

251

502

p450

PF00067 p450 40-472 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799417.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	40	472	5.5e-103	345.9	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943434.1
TAAATACCAATCACTACATTCAATTCATCAAACACCTGCTCATCATCATAGTATAATATTTGATCAACAATTAATGGAGATGGATCTTCCCTTCAACTTCACCACTACTCTCCTACTCCTTTCATCCTTCATCTTCTTCCTGCTCAAGGCATGGACCAAACCTAAATCCCCAAAACCTCACCAAAACCTGCCCCCGAGCCCGCCGAAGCTGCCGGTGATCGGCCACATCCACCTCCTAGTCGGAGATCTGCCTCACAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015163
ATGGAGATGGATCTTCCCTTCAACTTCACCACTACTCTCCTACTCCTTTCATCCTTCATCTTCTTCCTGCTCAAGGCATGGACCAAACCTAAATCCCCAAAACCTCACCAAAACCTGCCCCCGAGCCCGCCGAAGCTGCCGGTGATCGGCCACATCCACCTCCTAGTCGGAGATCTGCCTCACAAGGCATTGCAGCGGCAAGCGCAGAAACACGGCCCCGTGATGCATCTGCAGCTGGGGGAGGTCCCCGCGGTGGTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799417.1
MEMDLPFNFTTTLLLLSSFIFFLLKAWTKPKSPKPHQNLPPSPPKLPVIGHIHLLVGDLPHKALQRQAQKHGPVMHLQLGEVPAVVISSREATREVLKVQDPACADRPESIASKILWYDYTDIAFSAYNEYWRQMRKICIVELLSSKNVKSFGHIRRDESSRLIKSLEGSSGNAIDLTDKIFTFTSTITCRAAFGKVMTDRDGLIALFKEAVAMAGGFELADLFPSWKLLNVLSWSKYKLWRMRGKLDAILDGIIDEHKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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