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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004290`

染色体: Chr03 坐标: 61310806-61314240 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004290`
名称	SmilChr03G004290
描述	uncharacterized SmilChr03G004290
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61310806 - 61314240 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015168`
GeneID	`131015168`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015168`
原始查询	`SmilChr03G004290`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Plant Tudor-like RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829379]; symbol=AT4G32440; hit=AT4G32440; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Plant Tudor-like RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829379]; symbol=AT4G32440; hit=AT4G32440; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G32440` (AT4G32440) Plant Tudor-like RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829379] identity=34.7; qcov=0.833; evalue=9.05e-61; confidence=low
Rice	`Os02g0204500` (P0544H11.20-1) - identity=32.3; qcov=0.843; evalue=8.89e-54; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03735 (ENT); PF05641 (Agenet)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015168

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799422.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799422.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799422.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799422.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799422.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61311979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B131,D11
`Chr3:61312082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:61312105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B90,B92
`Chr3:61312192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C52
`Chr3:61312203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B106,B110,C38,C6
`Chr3:61312237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:61312271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B46,B90,B92
`Chr3:61312669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,D11
`Chr3:61312767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr3:61312779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr3:61312786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,B94,C35,D10
`Chr3:61312804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799422.1

522 aa

261

522

Agenet

ENT

PF05641 Agenet 6-63 aa PF03735 ENT 361-419 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799422.1`	Pfam	`PF05641`	Agenet	Domain	6	63	4.9e-13	50.1	Agenet domain
`XP_057799422.1`	Pfam	`PF03735`	ENT	Domain	361	419	1.3e-12	48.2	ENT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943439.1
CACAAATTAGGTGATTTCGTACAACCAAAGGGCGTGCATTGCGCACCCTGACCTTTTTTCTTTTAATTTTTTTTTTTTAATTTAATGGTTTGGATTAAGTTTTTAAATCAATATTTTTGATGAATACGAAATACTCTTTGTCGGATATATATCGAATTTTAATAAATTAATTTTTTTAGCTCAAATTAATTTTTCACCAAGCAAACGAGAGAAAAAACAAATATACAAAGAGAGAAGGGAAAAAACCCTAGTGAAAATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015168
ATGAAATTGAAGAAAGGGGACAAAGTGGAGGTTATGAACAAGAAAGAGAGTCCAGTTTCATGGCATGTTGCTGAGATTTTGTCTGGCGATGGACATACGTATCATTTGAAATATGATTCTTATCCCGGCATGTCAAGTGAACACAAAGTGGAGACTGTTTCAAGGATGTCTGTGAGGCCATGCCAGCCTTTGGTGCAAGGTGTAGATGATTACGTAGCTGGAGACGTTGTGGAGATATTTTACGAATATGCCTGGAAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799422.1
MKLKKGDKVEVMNKKESPVSWHVAEILSGDGHTYHLKYDSYPGMSSEHKVETVSRMSVRPCQPLVQGVDDYVAGDVVEIFYEYAWKAAAILNVLQGKRETKSKKISLRTAAVQKRYLVRLLGCSMESIVDGSNIRTKQTWHNGKWVLFEKSSRGAEDVTASKPSTSICHQNVNFKITLPKARAKKTPQDNCINILDENRFMESQRDSRSLKRMSPYGSSINEAHNGPIQKLRAIEKDGRKQRLAAAAAPVFEKAGSVSYP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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