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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004292`

染色体: Chr03 坐标: 61321866-61325448 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004292`
名称	SmilChr03G004292
描述	protein DUF642 L-GALACTONO-1,4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61321866 - 61325448 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015171`
GeneID	`131015171`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015171`
原始查询	`SmilChr03G004292`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DUF642 L-GALACTONO-1,4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2
产物	protein DUF642 L-GALACTONO-1%2C4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2
Arabidopsis	`AT5G11420` (AT5G11420) transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF642) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831013] identity=71.5; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0611000` (P0410E03.33-1) - identity=65.9; qcov=0.943; evalue=4.44e-174; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04862 (DUF642)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015171

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057799424.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057799424.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799424.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799424.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799424.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61322288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A16,B102,B29
`Chr3:61322579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C42
`Chr3:61322647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B108,C23,C37
`Chr3:61322705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B64,C9,D6
`Chr3:61323593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:61323695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,B95,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799424.1

370 aa

185

370

DUF642

PF04862 DUF642 26-182 aa PF04862 DUF642 193-360 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799424.1`	Pfam	`PF04862`	DUF642	Domain	26	182	2.2e-87	291.5	Protein of unknown function (DUF642)
`XP_057799424.1`	Pfam	`PF04862`	DUF642	Domain	193	360	2.2e-87	291.5	Protein of unknown function (DUF642)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943441.1
ACTAAATGAGCCCATGTGATACTACAGACTCATCGTGCTACGCTCCAAGAAACCCAATCCCCATTTACCAATTCGAAAAAATATATCATTTTTATTGGAAAATATATAAAATATTGTACAGAAATTGATTTTATCATACCAAACAACCATATTGGATTTTCTAAGATAAATAAAATTAAAGACCGTGACACAAGAGATTTGGGCAACAACGTTATTAAAACAAAAGTTGGGGCTAGTTTGGAGCGCTGGCATGCATAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015171
ATGGGGAGCTTCACTGCTTTGTCGGTGCTGTTGCTCTTAGCTTCTGCTTGCCACCATGCTTTTGCCTTCAGAGATGGGCTGTTGGACAATGGCAACTTTGAGATGGCCCCAGCTGCCTCCAACCTCAATGGCTCCGTCGTGCTCAAGCCCCACGCCATACCGAAATGGCAGATCTCCGGCTTTGTTGAGTACATCAAGGCGGGGCAGACGCAGGGCGACATGCTGCTGGTGGTGCCGGAGGGGTATGCTGCTGTGAGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799424.1
MGSFTALSVLLLLASACHHAFAFRDGLLDNGNFEMAPAASNLNGSVVLKPHAIPKWQISGFVEYIKAGQTQGDMLLVVPEGYAAVRLGNEASIKQVINVTKGMYYSLTFSAARTCAQEERVNVSVAPDFGVLPIQTLYSSNGWDSYAWAFKTSYTTAEILIHNPGVEEDPACGPLIDSIAIRALYPPRPTNQNLLKNGDFEEGAYIFPNTSWGVLIPPNIEDDNSPLPAWMVESLKAVKYIDAAHFSVPRGQRAIELVGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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