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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004298`

染色体: Chr03 坐标: 61378854-61387011 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004298`
名称	SmilChr03G004298
描述	carbon catabolite repressor protein 4 homolog 6
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61378854 - 61387011 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015178`
GeneID	`131015178`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015178`
原始查询	`SmilChr03G004298`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	carbon catabolite repressor protein 4 homolog 6
产物	carbon catabolite repressor protein 4 homolog 6
Arabidopsis	`AT5G11350` (AT5G11350) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831006] identity=45.8; qcov=0.902; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0610600` (P0410E03.25-1) - identity=58.8; qcov=0.323; evalue=1.21e-98; confidence=low
GO	GO:0000175 (3'-5'-RNA exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015178

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057799433.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799433.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799433.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799433.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799433.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61380321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr3:61380387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr3:61380458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B13,B55,C37
`Chr3:61380581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B94,C48
`Chr3:61380714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr3:61381008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C53,C77
`Chr3:61381017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C53,C77
`Chr3:61381102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:61381173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr3:61381279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr3:61381622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C61
`Chr3:61381788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799433.1

744 aa

372

744

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 139-325 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799433.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	139	325	9e-19	68.8	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943450.1
GATTTATAATTGACGATGCCTGAGGAATTAGGCACCGTGGGCGTGAGGAATTCAGGCAGCGGCGATGCGAGGTAGAAGCGCGCAAAGGCAGCTAGTGGTTTTTTGTGAATTTATATTTTGAATTTAATTATGGTTTTACCGTCGTGAAAATGATTTAGTAAATTTATGAAGACGTATTTGTCAGTTTTAATTTTTTAAAGTTGCATCACTACTTGGATTGGATCCACTCAATGACCCGCCGCCCTTTTCCCTTCCGATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015178
ATGCCAACCGCGGCTTCCGGCCGAGCTATAATGCTGTCCCTCCGCCGCCTCAATTGTATAGACCCGGGCAGCGGTTTCAGCAGCCCGGCCCCCCTATCGTGCAGGCGGATCAGCATCGGGGGCCTCCCCGGTTTAACCGTCCATCGCAGGCAGGGCCAGCTTCTGGTAACTATCAGCAGTTTAGACCACAGCAAATGCGGCAAGCAGTTCAGGCCTAGAGCCACAAAGCCTCTCGATTATAGAGAGTGGGAATACAGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799433.1
MPTAASGRAIMLSLRRLNCIDPGSGFSSPAPLSCRRISIGGLPGLTVHRRQGQLLVTISSLDHSKCGKQFRPRATKPLDYREWEYRKLRLPPHSERFTVLSYNILADYLATDHWHQLYYHIPRYIMDWNWRKKNIIFELGLWSADILCFQEVDRFQDLEAELKSRGYNGIWKMRTGYPVDGCAIFWRVSRFKMIFEESIEYNRLGLRDNVAQICVFESLNGRNISSGASTLSTSSASSNRVVVCNIHVLFNPKRGDIKLG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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