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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004321`

染色体: Chr03 坐标: 61575799-61578909 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004321`
名称	SmilChr03G004321
描述	uncharacterized SmilChr03G004321
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61575799 - 61578909 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019098`
GeneID	`131019098`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019098`
原始查询	`SmilChr03G004321`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNase P Rpr2/Rpp21 subunit domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834128]; symbol=AT5G41270; hit=AT5G41270; species=arabidopsis; confidence=low
产物	RNase P Rpr2/Rpp21 subunit domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834128]; symbol=AT5G41270; hit=AT5G41270; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G41270` (AT5G41270) RNase P Rpr2/Rpp21 subunit domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834128] identity=33; qcov=0.822; evalue=5.51e-17; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019098

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803764.1`
2	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057803764.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803764.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803764.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803764.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61575851`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A3,B103,B107,B121,B19,B30,B54,B62,C25,C36,C5,C52,C61,C85,C9,D7
`Chr3:61575888`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	38	A1,A10,A11,A16,B10,B102,B121,B127,B139,B17,B21,B32,B58,B62,B73,B76,B81,C10,C18,C20,C25,C28,C41,C45,C5,C52,C53,C56,C66,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C80,C9,D6
`Chr3:61575915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,C5,C53,C77
`Chr3:61575934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B133,B15
`Chr3:61575934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B15
`Chr3:61575973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B54,B62,C5
`Chr3:61575979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr3:61576003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr3:61576034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr3:61576076`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A10,A8,B118,B135,C58,C8
`Chr3:61576114`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B3,C27,C53
`Chr3:61576114`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B3,C27,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947781.1
ATGTACTACTGGAATGTGGTCAAATTAGCGATTAGGCTAGACTCTCTCTACTGTCGCTCCGATGTCGGCGCCGATAGAACGCCGCGACGCAGGCCACCCCTTCCCCCTTCCCCGTCGGCGGTCGCAGATCACCCGGCGTCTAGTCCACCTGCTCTTCACCACCAACTCCAGATTCCAGTTTCCGGCGGTTCTCCGCTTCTCCTTCAACTCTTCAAATGTGAATCTATTCTGCAACCTGGTAACAATTGCAGTGTTGGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019098
ATGTACTACTGGAATGTGGTCAAATTAGCGATTAGGCTAGACTCTCTCTACTGTCGCTCCGATGTCGGCGCCGATAGAACGCCGCGACGCAGGCCACCCCTTCCCCCTTCCCCGTCGGCGGTCGCAGATCACCCGGCGTCTAGTCCACCTGCTCTTCACCACCAACTCCAGATTCCAGTTTCCGGCGGTTCTCCGCTTCTCCTTCAACTCTTCAAATGTGAATCTATTCTGCAACCTGGTAACAATTGCAGTGTTGGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803764.1
MYYWNVVKLAIRLDSLYCRSDVGADRTPRRRPPLPPSPSAVADHPASSPPALHHQLQIPVSGGSPLLLQLFKCESILQPGNNCSVGIQKKRSKVRHRRKGLKGDIVCRYQFCCHQNMMRGTLKGYVKEICPPKPKPAPNLKKVQENHPSAGNAATAVEVDSDSLLPFDGQNPETRSPTTPLPKTGVSLLDSRRRKRNCSGAKKVDEAQISSAAADMEKSVEASSKTRKKSWTSLKEIAESSGKKFTDLTVPFFICVTV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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