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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004328`

染色体: Chr03 坐标: 61634316-61638443 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004328`
名称	SmilChr03G004328
描述	protein TIFY 8
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61634316 - 61638443 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015276`
GeneID	`131015276`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015276`
原始查询	`SmilChr03G004328`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIFY 8
产物	protein TIFY 8
Arabidopsis	`AT4G32570` (TIFY8) TIFY domain protein 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829392] identity=36.8; qcov=0.863; evalue=3.64e-38; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0009611 (response to wounding); GO:0031347 (regulation of defense response); GO:2000022 (regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF06200 (tify)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015276

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799586.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799586.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799586.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799586.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799586.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61634615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr3:61634645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr3:61634663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:61635749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B62,C74
`Chr3:61635937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,C54,C78
`Chr3:61636034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:61636187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:61636298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C77
`Chr3:61636309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr3:61636610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B65
`Chr3:61637866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:61637888`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A1,A13,A6,B11,B128,B28,B43,B51,B61,B62,B80,B93,C2,C20,C81,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799586.1

372 aa

186

372

tify

PF06200 tify 282-314 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799586.1`	Pfam	`PF06200`	tify	Domain	282	314	1.3e-14	53.9	tify domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943603.1
CATAAAAATAAAAAGTTTACTAGGAGAGAGAGAACTGAAAAGATACTATTAATAAAAGAAGAAAGCACATCTGTATCTGTGAATGCCAGAAAAATACTTTTCCTTTTTAGTGCTCTCCCTCTCTCACCTTCAAAAAAAAAAAAAAACAGAAAACCAAAAAAAGAGCTCAAGAATTCTCTCTCTTTCTCTTTTCATGAAATTCGTGCTCTCCCTTCAAGTGTTTCACTCTTTTCCTCGCAAAAGAATTACCTTTCTCGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015276
ATGGCTCATGCTCACAGCAACTGTAAAAATAACAGAGCAGCTGCCACTATTAATGCCGGCGGCGAAAGCGAAGTGAAGCCCGCAACTTTTCATGATTTTCTTGGCGATAAGGGCCAACCCCAAGATTCTGCTCCGCCGCCGCCGGAAGTGTCGCCGTCCGCCACTTCTGATCTGGGCTCCGAAAGACATGTCAGCAATCACTTGGAAGGGATACCATTTTATGGATCAAGAGGCGATGTTGTCGTGCCTGAAAGTAGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799586.1
MAHAHSNCKNNRAAATINAGGESEVKPATFHDFLGDKGQPQDSAPPPPEVSPSATSDLGSERHVSNHLEGIPFYGSRGDVVVPESSNRFMSNKRSNSDSFMMSSRDKFPQGPTDSQDSQLLTKLLRYSGGERPKRPHDEEASFGMHQMRPLSASFISQTSTGGRTDNNPSKWDRATAVNPGPAMQYPPRTGQVMPFGYHAQSNRFKETNVGPSLMSQTAADEGSRTGIKGSGILSSFNAAGAISGSGRQPAGVLIRSGKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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