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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004337`

染色体: Chr03 坐标: 61698102-61699621 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004337`
名称	SmilChr03G004337
描述	expansin-like B1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61698102 - 61699621 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015292`
GeneID	`131015292`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015292`
原始查询	`SmilChr03G004337`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	expansin-like B1
产物	expansin-like B1
Arabidopsis	`AT4G17030` (EXLB1) expansin-like B1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827411] identity=46; qcov=0.806; evalue=2.84e-62; confidence=high
Rice	`Os07g0496250` (EXLB1) - identity=63.7; qcov=0.892; evalue=7.52e-115; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region)
KEGG	-
Pfam	PF01357 (Expansin_C); PF03330 (DPBB_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015292

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057799623.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057799623.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799623.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799623.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799623.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61698110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:61698130`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A25
`Chr3:61698130`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A25
`Chr3:61698149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B40,B78
`Chr3:61698159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C1,D11
`Chr3:61698163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B63
`Chr3:61698176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:61698191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,A5,B131,D11
`Chr3:61698208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,D11
`Chr3:61698210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C43
`Chr3:61698248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,D4
`Chr3:61698275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B63,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799623.1

278 aa

139

278

DPBB_1

Expansin_C

PF03330 DPBB_1 92-165 aa PF01357 Expansin_C 177-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799623.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	92	165	1.2e-12	48.6	Lytic transglycolase
`XP_057799623.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	177	258	8.8e-14	52.1	Expansin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943640.1
ATGCATTCGAGCTCGTCTTCTTTCTTCCCTTTTCGTCTTCTAAACTTGCTCTACGTCGCTAGGATGGCATCATGCCTCAAGTTTGTATTCGGTCTTCTTGCAGCGGCACTTTTCCTCTTGGAATCTCTCGGGGATGCTGCTCCGTGCACGGATTGTTTCACGCAGTCGAGGGCGTCTTACTACCCGAATTCTGATGAGAAAGGCACAGAAACTGGACGATGTGGCTTTGGTACATTTGGGGCAACAATTAACAATGGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015292
ATGCATTCGAGCTCGTCTTCTTTCTTCCCTTTTCGTCTTCTAAACTTGCTCTACGTCGCTAGGATGGCATCATGCCTCAAGTTTGTATTCGGTCTTCTTGCAGCGGCACTTTTCCTCTTGGAATCTCTCGGGGATGCTGCTCCGTGCACGGATTGTTTCACGCAGTCGAGGGCGTCTTACTACCCGAATTCTGATGAGAAAGGCACAGAAACTGGACGATGTGGCTTTGGTACATTTGGGGCAACAATTAACAATGGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799623.1
MHSSSSSFFPFRLLNLLYVARMASCLKFVFGLLAAALFLLESLGDAAPCTDCFTQSRASYYPNSDEKGTETGRCGFGTFGATINNGDVSAASDLYRDGLGCGACYQVRCTNSKYCSDKGVNVVITDHGSSHNTDFILSSRAFGRMAQNADAGASLLTFGVIDIEYKRISCSYPNKNITIKIDESSSNPHYLAFVIWYQQGMKDITAVQLCETQSYTCKLLDRSYGAVWTATSPPSGPLSVRMLFSDENGDEKWIVPVNDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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