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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004338`

染色体: Chr03 坐标: 61704223-61707318 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004338`
名称	SmilChr03G004338
描述	psbP domain-containing protein 5, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61704223 - 61707318 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015289`
GeneID	`131015289`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015289`
原始查询	`SmilChr03G004338`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	psbP domain-containing protein 5, chloroplastic
产物	psbP domain-containing protein 5%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G11450` (PPD5) PsbP domain protein (Mog1/PsbP/DUF1795-like photosystem II reaction center PsbP family protein) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831016] identity=60.7; qcov=0.99; evalue=4.21e-118; confidence=high
Rice	`Os01g0617900` (P0686E09.32-2) - identity=69.6; qcov=0.772; evalue=6.69e-113; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01789 (PsbP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015289

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057799619.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057799619.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057799619.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057799619.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799619.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61704489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,C47,C82
`Chr3:61704621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr3:61704637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr3:61705162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr3:61705170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr3:61705249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B23,C13
`Chr3:61706281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B113,B15,C34
`Chr3:61706318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B113,B15,C34,C77
`Chr3:61706754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,C15,C6,D2
`Chr3:61706755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C1,C83,D4
`Chr3:61707177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C1,C83,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799619.1

298 aa

149

298

PsbP

PF01789 PsbP 181-279 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799619.1`	Pfam	`PF01789`	PsbP	Domain	181	279	6e-13	49.8	PsbP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943636.1
CCCCATAAATTATTGCAAAATTCATAAAGATGCAGTTTTTCAGTTATCTTTAACAAACCACAGTGGATGAGAGAAGAAAAGAATGGCAGCATCTCTTCCCACAGTTAAATCCCATCATTCTCTCTCTCCAAACTTTGCCATTTTTGGAAACAATGCTCAAAGCATGCCCATTTCAAGCAGGAGGAAACCCAAAATGCGTGGGAAATCGAGCAAAACAGTTGTGTGCTCGAGTAATTCTTCAAGACCCTTTTTGCAAAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015289
ATGGCAGCATCTCTTCCCACAGTTAAATCCCATCATTCTCTCTCTCCAAACTTTGCCATTTTTGGAAACAATGCTCAAAGCATGCCCATTTCAAGCAGGAGGAAACCCAAAATGCGTGGGAAATCGAGCAAAACAGTTGTGTGCTCGAGTAATTCTTCAAGACCCTTTTTGCAAAATGGGATTTTGAGGAGGGATTTGATGTTCTTGGGGTTGTCCTCCTCTCTTTCTCTTGCTTTCCCAGCTTTAGGAGCTGGTGCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799619.1
MAASLPTVKSHHSLSPNFAIFGNNAQSMPISSRRKPKMRGKSSKTVVCSSNSSRPFLQNGILRRDLMFLGLSSSLSLAFPALGAGAEEELKTDLFVDKTNAYSYLYPTALPSGKFVFKWVESRKPERYSSAAPLSPDARLRIVSERVDFIDNLIITVSIGPPNPLFLKSNDKSTWNAKDVANSVLADKSALRVTTSQRTDGTSILDAHSSTVDSEPYWYYEYLVRKSPTEAAPSSNLYRHFVAVTAEREGYLYSLNASTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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