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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004341`

染色体: Chr03 坐标: 61717986-61721047 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004341`
名称	SmilChr03G004341
描述	60S ribosomal protein L11-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61717986 - 61721047 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015300`
GeneID	`131015300`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015300`
原始查询	`SmilChr03G004341`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L11-like
产物	60S ribosomal protein L11-like
Arabidopsis	`AT2G42740` (RPL16A) ribosomal protein large subunit 16A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818874] identity=95.6; qcov=0.989; evalue=1.01e-128; confidence=high
Rice	`Os05g0207300` (OsRPL5) - identity=96; qcov=0.973; evalue=2.05e-126; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00281 (Ribosomal_L5); PF00673 (Ribosomal_L5_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015300

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057799636.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799636.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057799635.1`
4	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057799636.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799635.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61718069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B85,B93
`Chr3:61718084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C82
`Chr3:61718107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A22,B82,D4
`Chr3:61719787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr3:61720498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,D1
`Chr3:61720527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B88,C1,C32,C68,D11
`Chr3:61720530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B66,D1
`Chr3:61720578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr3:61720807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:61720828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B88,C1,C32,C68,D11
`Chr3:61720858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799635.1

212 aa

106

212

Ribosomal_L5

Ribosomal_L5_C

PF00281 Ribosomal_L5 39-92 aa PF00673 Ribosomal_L5_C 96-194 aa

XP_057799636.1

182 aa

182

Ribosomal_L5

Ribosomal_L5_C

PF00281 Ribosomal_L5 9-62 aa PF00673 Ribosomal_L5_C 66-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799635.1`	Pfam	`PF00281`	Ribosomal_L5	Domain	39	92	3.8e-21	75.8	Ribosomal protein L5
`XP_057799635.1`	Pfam	`PF00673`	Ribosomal_L5_C	Domain	96	194	2.5e-18	66.7	ribosomal L5P family C-terminus
`XP_057799636.1`	Pfam	`PF00281`	Ribosomal_L5	Domain	9	62	2.9e-21	76.2	Ribosomal protein L5
`XP_057799636.1`	Pfam	`PF00673`	Ribosomal_L5_C	Domain	66	164	1.7e-18	67.2	ribosomal L5P family C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943652.1
GCACGGTCCAGCCCACACACAAAAAACCTAGGTCACTTCATGTTTAGGGGCTGCAGCTCATTCTCTCACAAACTCCTGCTGCCGCCGCGCCTCCATCGCCATCTACCGTCGTCCATCCACCGCGTAGCCATGGCCTCGGAGAAGAAATTGTCGAACCCGATGAGGGAGATCAAGGTGCAGAAGCTGGTGCTCAACATCTCCGTCGGAGAGAGTGGAGATCGTCTCACCAGAGCTGCAAAGGTGCTGGAGCAACTCAGTGG...

XM_057943653.1
TCCTGCTGCCGCCGCGCCTCCATCGCCATCCACCGCGTAGCCATGGCCTCGGAGAAGAAATTGTCGAACCCGATGAGGGAGATCAAGGTGCAGAAGCTGGTGCTCAACATCTCCGTCGGAGAGAGTGGAGATCGTCTCACCAGAGCTGCAAAGGTGCTGGAGCAACTCAGTGGTCAAAGTCCTGTTTTCTCCAAGGCAAGATACACTGTTCGATCTTTTGGGATCAGGCGTAATGAAAAAATTGCTTGCTATGTCACGGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015300
ATGTTTAGGGGCTGCAGCTCATTCTCTCACAAACTCCTGCTGCCGCCGCGCCTCCATCGCCATCTACCGTCGTCCATCCACCGCGTAGCCATGGCCTCGGAGAAGAAATTGTCGAACCCGATGAGGGAGATCAAGGTGCAGAAGCTGGTGCTCAACATCTCCGTCGGAGAGAGTGGAGATCGTCTCACCAGAGCTGCAAAGGTGCTGGAGCAACTCAGTGGTCAAAGTCCTGTTTTCTCCAAGGCAAGATACACTGTTCG...

LOC131015300
ATGGCCTCGGAGAAGAAATTGTCGAACCCGATGAGGGAGATCAAGGTGCAGAAGCTGGTGCTCAACATCTCCGTCGGAGAGAGTGGAGATCGTCTCACCAGAGCTGCAAAGGTGCTGGAGCAACTCAGTGGTCAAAGTCCTGTTTTCTCCAAGGCAAGATACACTGTTCGATCTTTTGGGATCAGGCGTAATGAAAAAATTGCTTGCTATGTCACGGTGAGAGGTGACAAGGCAATGCAACTCCTTGAGAGTGGCCTGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799635.1
MFRGCSSFSHKLLLPPRLHRHLPSSIHRVAMASEKKLSNPMREIKVQKLVLNISVGESGDRLTRAAKVLEQLSGQSPVFSKARYTVRSFGIRRNEKIACYVTVRGDKAMQLLESGLKVKEYELLRRNFSETGCFGFGIQEHIDLGIKYDPSTGIYGMDFYVVLERPGYRVGRRRRCKARVGIQHRVTKDDAMKWFQVKYEGVILNKASNIGA

XP_057799636.1
MASEKKLSNPMREIKVQKLVLNISVGESGDRLTRAAKVLEQLSGQSPVFSKARYTVRSFGIRRNEKIACYVTVRGDKAMQLLESGLKVKEYELLRRNFSETGCFGFGIQEHIDLGIKYDPSTGIYGMDFYVVLERPGYRVGRRRRCKARVGIQHRVTKDDAMKWFQVKYEGVILNKASNIGA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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