当前解析结果
SmilChr03G004352| 统一新 Gene ID | SmilChr03G004352 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G004352 |
| 描述 | molybdate transporter 1 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 61759108 - 61760660 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131015262 |
|---|---|
| GeneID | 131015262 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131015262 |
| 原始查询 | SmilChr03G004352 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | molybdate transporter 1 |
| 产物 | molybdate transporter 1 |
| Arabidopsis | AT2G25680 (MOT1)molybdate transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817109] identity=64.1; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os08g0101500 (OsSultr5)- identity=63.7; qcov=0.926; evalue=3.19e-167; confidence=high |
| GO | GO:0015098 (molybdate ion transmembrane transporter activity); GO:0015689 (molybdate ion transport) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF16983 (MFS_MOT1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131015262 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057799560.1 |
| 2 | Vacuole | 液泡 | 0.60000 | XP_057799560.1 |
| 3 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.60000 | XP_057799560.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057799560.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057799560.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:61759294 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B34 |
Chr3:61759344 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D3 |
Chr3:61759346 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D3 |
Chr3:61759457 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B97 |
Chr3:61759509 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | C16,C27,C29,C50,C55 |
Chr3:61759509 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | C16,C27,C29,C50,C55 |
Chr3:61759517 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C59,C61 |
Chr3:61759520 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B136 |
Chr3:61759550 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C60,C82,D8 |
Chr3:61759553 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A3,B136,C13,C32,C68 |
Chr3:61759573 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B76 |
Chr3:61759573 |
CG |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B76 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057799560.1PF16983
MFS_MOT1 35-149 aa
PF16983
MFS_MOT1 276-395 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057799560.1 |
Pfam | PF16983 |
MFS_MOT1 | Family | 35 | 149 | 3.1e-60 | 202.4 | Molybdate transporter of MFS superfamily |
XP_057799560.1 |
Pfam | PF16983 |
MFS_MOT1 | Family | 276 | 395 | 3.1e-60 | 202.4 | Molybdate transporter of MFS superfamily |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。