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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004353`

染色体: Chr03 坐标: 61764931-61771322 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004353`
名称	SmilChr03G004353
描述	uncharacterized SmilChr03G004353
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61764931 - 61771322 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015235`
GeneID	`131015235`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015235`
原始查询	`SmilChr03G004353`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0309100; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os09g0309100; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G60560` (AT1G60560) SWIM zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842351] identity=41.6; qcov=0.957; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os09g0309100` - identity=42.8; qcov=0.98; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015235

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799518.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057799518.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057799518.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057799518.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799518.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61765654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B109,B83
`Chr3:61765675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:61765810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:61766067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B56,B96,C1,C45
`Chr3:61766408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,A5,B5,C13,C62
`Chr3:61766429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr3:61766534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:61766576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr3:61767323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr3:61767333`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	112	A11,A13,A18,A19,A2,A20,A4,A6,A7,B104,B106,B107,B108,B109,B114,B115,B117,B118,B12,B121,B122,B128,B13,B138,B139,B140,B16,B17,B19,B2,B23,B25,B28,B3,B30,B31,B32,B35,B40,B42,B43,B44,B46,B5,B51,B54,B55,B56,B58,B59,B6,B60,B62,B64,B66,B69,B75,B76,B77,B78,B8,B82,B83,B84,B85,B86,B94,B96,B97,C10,C15,C19,C25,C29,C30,C31,C33,C35,C36,C38,C4,C42,C44,C45,C49,C5,C51,C53,C54,C56,C60,C61,C70,C72,C73,C78,C79,C8,C80,C82,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D2,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr3:61767358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,A4,B113,B34,B91
`Chr3:61767390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

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cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943537.1
GGGGCAAGCAGTGCTCATGGAAGCCCATGCTTGCAAGGTTGTACGTTACTCTTTGAGAGTGGTACTTATACATATACCGTACATGTATATAATGCAAGCCAAAAATAGAAAAATAAAAAAGAGAGAGGGGAAGAAGAAATTAGCAAACTCCCGAGAAAACTTCTTCAGACTTGGAGTTTGTTCTACTCAAATCAATTTTTATCTACCATTGCGCGGTAATTCTCGATTGAAAATCCAGTAATTTGGCAGACTCGAATGTC...

XM_057943535.1
TTATACATATACCGTACATGTATATAATGCAAGCCAAAAATAGAAAAATAAAAAAGAGAGAGGGGAAGAAGAAATTAGCAAACTCCCGAGAAAACTTCTTCAGACTTGGAGTTTGTTCTACTCAAATCAATTTTTATCTACCATTGCGCGAAAATACAGAATTTTTTGATTCAATCACCGAAGATAAGCGTGGAGGAGGAAAGAATGAAGAGCAATGAAGCAAAGGTGGCGAGGATGGAAGACATACTAAACCTACCGGT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131015235
ATGAAGAGCAATGAAGCAAAGGTGGCGAGGATGGAAGACATACTAAACCTACCGGTGCAAGATCCTCCTTATTCCGAGTTTTCTGCAGCTCATATAAATTGGGTTAAAGTAGAAGGTGGTCGTCAAGGCGGTGATGATATTGCACTGATTCCTTTTTCTAGAGTGGATGATTTTGTGAAAGGTGAATCCAGCAATGCAGAGTGCCCAGCTAGCTTTCGTGTCGAATCAAGAAGGAAGAGACCAGAAGGGAGTCTGAACAG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057799518.1
MKSNEAKVARMEDILNLPVQDPPYSEFSAAHINWVKVEGGRQGGDDIALIPFSRVDDFVKGESSNAECPASFRVESRRKRPEGSLNRPRVDGYLEYTLYWCSYGPEDYRDAEPHIGENSSVKPASGKGSRPGRRHMMRGCLCHFTVKRLYTRPLLALIIYNQRNHVDKIGAPCHGILDQEALGTRAMYAPRISDELRQKVMAMLHVGVSLDTIVQHHMEEVQRHGGPHNRDDFLTRNDVRNMERLIRNTSHELHSNVECS...

XP_057799519.1
MKSNEAKVARMEDILNLPVQDPPYSEFSAAHINWVKVEGGRQGGDDIALIPFSRVDDFVKGESSNAECPASFRVESRRKRPEGSLNRPRVDGYLEYTLYWCSYGPEDYRDAEPHIGENSSVKPASGKGSRPGRRHMMRGCLCHFTVKRLYTRPLLALIIYNQRNHVDKIGAPCHGILDQEALGTRAMYAPRISDELRQKVMAMLHVGVSLDTIVQHHMEEVQRHGGPHNRDDFLTRNDVRNMERLIRNTSHELHSNVECS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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