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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004382`

染色体: Chr03 坐标: 62026887-62029727 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004382`
名称	SmilChr03G004382
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62026887 - 62029727 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019124`
GeneID	`131019124`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019124`
原始查询	`SmilChr03G004382`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
Arabidopsis	`AT3G47570` (AT3G47570) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823911] identity=35.7; qcov=1.07; evalue=1.57e-124; confidence=medium
Rice	`Os11g0208900` - identity=40.8; qcov=0.997; evalue=2.85e-135; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019124

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057803792.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803792.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803792.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803792.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803792.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62027866`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B55,B69,B96,C35,D5
`Chr3:62027866`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B55,B69,B96,C35,D5
`Chr3:62028023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr3:62028046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr3:62028090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr3:62028200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B3
`Chr3:62028248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C33
`Chr3:62028275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C33
`Chr3:62028305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C54
`Chr3:62028336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C33
`Chr3:62028380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,C10,C53,C71
`Chr3:62028383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803792.1

622 aa

311

622

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00560 LRR_1 24-45 aa PF00560 LRR_1 71-93 aa PF00560 LRR_1 122-141 aa PF00560 LRR_1 143-165 aa PF00560 LRR_1 168-188 aa PF00069 Pkinase 311-610 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 313-462 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803792.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	24	45	1.2e-20	69.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057803792.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	71	93	1.2e-20	69.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057803792.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	122	141	1.2e-20	69.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057803792.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	143	165	1.2e-20	69.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057803792.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	168	188	1.2e-20	69.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057803792.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	311	610	1.4e-34	120.4	Protein kinase domain
`XP_057803792.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	313	462	3.1e-34	119.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947809.1
CTCTTCAGGATTTAGCTCTTGGTGGCAACAATTTGAATGGTATGGTTCAAGTTCTTATCACATAAATTTGTGTAAATGAGATTTTATTAGTTTGATGACACTTTTTTTGCCAGGAATACTACCACATGAGATTGGCCATCTTCAAAGTCTGGTTGCTTTTGGTGCTGAACGGAATGAGATTGCTGGCTCAATCGATTTCAATATTTTCATTAATATGTCTTCTCTGCAAACCTTAGCACTAGGGCGTAACAAATTCACGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019124
ATGGTACTGGGTTTATCTGGGAATGAGTTATCTGGTAATATTCCACTAACTATAAACCATTTCCATCAACTTCAAGGATTATATCTGTCTCGTAACATGTTGGGAGGCTCAATACCACATGGTATATGTGATCTATTCAGCCTCTATACTTTATCTATGTACCAGAATCAATTTTCAGGCCCAATTCCTAAATGTCTGGGAAATGTCTCATCCTTAAGATATCTTTATCTAGACTCCAACATTTTGAATTCAAGCATACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803792.1
MVLGLSGNELSGNIPLTINHFHQLQGLYLSRNMLGGSIPHGICDLFSLYTLSMYQNQFSGPIPKCLGNVSSLRYLYLDSNILNSSIPSSLWGLKDLIELYLSSNSLNGSLTLEMSNLGAAIYINLSMNQLSGSIPSTIGKLQHLIYLSLANNRLEGSIPVSMGSMISLGNLDLSYNNLSGSIPKSLEALQHLDYFNVSFNSLSGEIPNGGSFRNFNMDSFKGNEALCGIPKFHVQICSSISNHTSKRKKVERASFIVFGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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