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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004385`

染色体: Chr03 坐标: 62061252-62064809 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004385`
名称	SmilChr03G004385
描述	putative receptor-like protein kinase At3g47110
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62061252 - 62064809 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015306`
GeneID	`131015306`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015306`
原始查询	`SmilChr03G004385`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative receptor-like protein kinase At3g47110
产物	putative receptor-like protein kinase At3g47110
Arabidopsis	`AT3G47110` (AT3G47110) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823864] identity=36; qcov=0.85; evalue=1.13e-21; confidence=medium
Rice	`Os01g0152800` (OsRLCK25) - identity=41.5; qcov=0.812; evalue=5.59e-21; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08263 (LRRNT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015306

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057799643.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057799643.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057799643.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799643.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799643.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62061287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B119,B17,C5,C83
`Chr3:62061299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B1,B17
`Chr3:62061345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B1,B17
`Chr3:62061350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B54,C41
`Chr3:62061352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C8
`Chr3:62061373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B59,B7,B81
`Chr3:62061431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B31,B97,C15,C54
`Chr3:62061435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr3:62061437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B19,C46
`Chr3:62061445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B23,C9
`Chr3:62061445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,C9
`Chr3:62061453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B127,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799643.1

160 aa

160

LRRNT_2

PF08263 LRRNT_2 33-68 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799643.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	33	68	7.6e-07	30.0	Leucine rich repeat N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098487.1
TTTGCAGCCATGGAGAAAAAGCTTTATTGCATTTTGCCTTATGCATTCCTAATTACCATAACCTTCCCAATGCTTTCTTCTGAATCCAAACAACCTTTGAGCCTTGCAACTGATCAAACTGCCCTTCTTTCACTCAAACATACATCTCTTTTACTTGCAACTAATTGGACCAACTCCACCTCCGTCTGCAGCTGGATTGGCGTCACTTGCAGCTTGCGCCACCACAGAGTAGCTGCCTTGAATCTCTCCAACATGGCTCT...

XM_057943660.1
TTTGCAGCCATGGAGAAAAAGCTTTATTGCATTTTGCCTTATGCATTCCTAATTACCATAACCTTCCCAATGCTTTCTTCTGAATCCAAACAACCTTTGAGCCTTGCAACTGATCAAACTGCCCTTCTTTCACTCAAACATACATCTCTTTTACTTGCAACTAATTGGACCAACTCCACCTCCGTCTGCAGCTGGATTGGCGTCACTTGCAGCTTGCGCCACCACAGAGTAGCTGCCTTGAATCTCTCCAACATGGCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015306
ATGGAGAAAAAGCTTTATTGCATTTTGCCTTATGCATTCCTAATTACCATAACCTTCCCAATGCTTTCTTCTGAATCCAAACAACCTTTGAGCCTTGCAACTGATCAAACTGCCCTTCTTTCACTCAAACATACATCTCTTTTACTTGCAACTAATTGGACCAACTCCACCTCCGTCTGCAGCTGGATTGGCGTCACTTGCAGCTTGCGCCACCACAGAGTAGCTGCCTTGAATCTCTCCAACATGGCTCTCTCCGCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799643.1
MEKKLYCILPYAFLITITFPMLSSESKQPLSLATDQTALLSLKHTSLLLATNWTNSTSVCSWIGVTCSLRHHRVAALNLSNMALSATIPPQLGHLSFLVSLDLSNNLFYGDLPHQLSLLRRLKFISFQLNNFTGDIPPTQLNIGLHRSRVWLGRASFNEV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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