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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004402`

染色体: Chr03 坐标: 62202078-62204871 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004402`
名称	SmilChr03G004402
描述	receptor kinase-like protein Xa21
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62202078 - 62204871 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015231`
GeneID	`131015231`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015231`
原始查询	`SmilChr03G004402`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor kinase-like protein Xa21
产物	receptor kinase-like protein Xa21
Arabidopsis	`AT3G47570` (AT3G47570) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823911] identity=38.7; qcov=0.996; evalue=5.39e-150; confidence=medium
Rice	`Os11g0695000` - identity=40.2; qcov=0.965; evalue=4.72e-162; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015231

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057799511.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799511.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799511.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799511.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799511.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62203349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B43
`Chr3:62204519`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B99
`Chr3:62204519`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799511.1

781 aa

390

781

LRR_1

LRR_8

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00560 LRR_1 40-60 aa PF00560 LRR_1 261-282 aa PF00560 LRR_1 357-379 aa PF13855 LRR_8 357-416 aa PF00560 LRR_1 381-402 aa PF00069 Pkinase 525-692 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 527-691 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799511.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	40	60	9.8e-26	85.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057799511.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	261	282	9.8e-26	85.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057799511.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	357	379	9.8e-26	85.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057799511.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	357	416	1.1e-21	77.1	Leucine rich repeat
`XP_057799511.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	381	402	9.8e-26	85.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057799511.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	525	692	2.5e-33	116.3	Protein kinase domain
`XP_057799511.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	527	691	3.5e-32	112.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943528.1
CTACCACATGAGATTGGCCATCTTCAGAGTCTGCTTACTTTTGCTGCTGAAGGCAATCAGATTGCGGGCTCAATTGATTTCAATATTTTCATGAATATGTCTTCTCTGCAAACCTTAACACTATGGCGTAACAAATTCACGGGGAACCTTTCAAGGGATGTCGGGAATATTACCATGCTAACAGAGCTACATCTCCATGAAAACCATTTTACAGGTACAACAGAGTAATTTTCATGTAAATTGTCTATTTAGCTACAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015231
ATGAAAACCATTTTACAGGTACAACAGAGTAATTTTCATGTAAATTGTCTATTTAGCTACAGTTTTGAAATCTCATGTTTTGCAGGGCTTATTCCCACTGAATTTGGCCAACTTTATTTGGAGTCATTATTACTACAGTCGAACAGCTTGAGTGGTTCGATTCCACATGAGCTCTTTAACATTTCAACTCTTCGGATGCTTGCACTTGGCGACAATGCTCTGTCAGGGGTTCTTCCAACCCATTTATGCCATGCCTCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799511.1
MKTILQVQQSNFHVNCLFSYSFEISCFAGLIPTEFGQLYLESLLLQSNSLSGSIPHELFNISTLRMLALGDNALSGVLPTHLCHASPFLERLILGINSITGAIPNTISNCSRLTILSIPENKFSGYIPTHLGNLRLLQFLSIFGNNLTQAPSSSFFTSLTNCRSLIGFDISDNPLNGVIPASVGNLSSSLQTFAADNCKFSGSIPVEIGNLSSLITLYLPRNELSGNIPLTISHLHELQGLYLLDNMLGGSIPHAICDLF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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