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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004408`

染色体: Chr03 坐标: 62234650-62235486 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004408`
名称	SmilChr03G004408
描述	putative receptor-like protein kinase At3g47110
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62234650 - 62235486 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019134`
GeneID	`131019134`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019134`
原始查询	`SmilChr03G004408`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative receptor-like protein kinase At3g47110
产物	putative receptor-like protein kinase At3g47110
Arabidopsis	`AT5G20480` (EFR) EF-TU receptor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832170] identity=39.6; qcov=0.863; evalue=2.25e-43; confidence=medium
Rice	`Os11g0490200` - identity=45.7; qcov=0.835; evalue=2.74e-49; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF12799 (LRR_4); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019134

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057803803.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803803.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803803.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803803.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803803.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62234720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr3:62234753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr3:62234777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B60,C25
`Chr3:62234820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B31,B64,B9,C86
`Chr3:62234829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:62234832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr3:62234838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:62234982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B65,C3,C46
`Chr3:62234991`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C41
`Chr3:62234991`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C41
`Chr3:62235064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B65,B86
`Chr3:62235099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,B94,C6,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803803.1

278 aa

139

278

LRRNT_2

LRR_1

LRR_4

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 35-70 aa PF00560 LRR_1 124-143 aa PF12799 LRR_4 147-187 aa PF00560 LRR_1 148-169 aa PF13855 LRR_8 170-230 aa PF00560 LRR_1 171-193 aa PF00560 LRR_1 195-217 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803803.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	35	70	7.2e-07	30.1	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057803803.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	124	143	4.2e-18	62.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057803803.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	147	187	5.7e-14	52.5	Leucine Rich repeats (2 copies)
`XP_057803803.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	148	169	4.2e-18	62.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057803803.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	170	230	2.9e-12	46.9	Leucine rich repeat
`XP_057803803.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	171	193	4.2e-18	62.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057803803.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	195	217	4.2e-18	62.3	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947820.1
ATGGAGAAAAAGCTTTATTGCATTTTGCAGTATGCATTCCTAATTACCATAACCTTCCAAATGCTTTCTTCTGAAGCCAAAGCCAAACAACCTCTGAGCCTTGCAACTGATCAAACTGCCCTTCTTTCACTCAAACATACATCTCTTTTACTTGCATCTAATTGGACCAACTCCACCTCCGTCTGCAGCTGGATTGGCGTCACTTGCAGCTTGCGCCACCACAGAGTATCTGCCTTGAATCTCTCCAACATGGCTCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019134
ATGGAGAAAAAGCTTTATTGCATTTTGCAGTATGCATTCCTAATTACCATAACCTTCCAAATGCTTTCTTCTGAAGCCAAAGCCAAACAACCTCTGAGCCTTGCAACTGATCAAACTGCCCTTCTTTCACTCAAACATACATCTCTTTTACTTGCATCTAATTGGACCAACTCCACCTCCGTCTGCAGCTGGATTGGCGTCACTTGCAGCTTGCGCCACCACAGAGTATCTGCCTTGAATCTCTCCAACATGGCTCTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803803.1
MEKKLYCILQYAFLITITFQMLSSEAKAKQPLSLATDQTALLSLKHTSLLLASNWTNSTSVCSWIGVTCSLRHHRVSALNLSNMALSATIPLQLGHLSFLVSLDLSNMALSATIPLQLGHLSFLVSLDLSNNLFYGHLPHQLSLLRRLKFISLRLNNFTGDIPPMLGHLPKLEYLSLRNNSFIGSIPKSLSNLTNLQLLDLSYNSLSGEIPKEFGRLQSLQTLSVQFNRLSGAISSAIFNISTLVTIDLTGIELSGSLPT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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