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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004419`

染色体: Chr03 坐标: 62347188-62371642 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004419`
名称	SmilChr03G004419
描述	uncharacterized SmilChr03G004419
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62347188 - 62371642 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015200`
GeneID	`131015200`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015200`
原始查询	`SmilChr03G004419`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger FYVE domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817114]; symbol=AT2G25730; hit=AT2G25730; species=arabidopsis; confidence=high
产物	zinc finger FYVE domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817114]; symbol=AT2G25730; hit=AT2G25730; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G25730` (AT2G25730) zinc finger FYVE domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817114] identity=62.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0593000` - identity=74.6; qcov=0.106; evalue=2.69e-137; confidence=weak
GO	-
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF25569 (TPR_ZFYVE26)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015200

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057799458.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057799458.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057799458.1`
4	Phragmoplast	Phragmoplast	0.20000	`XP_057799458.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799458.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62347998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr3:62350047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr3:62351006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:62353636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B85,C76
`Chr3:62353650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr3:62353703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B71,C43
`Chr3:62353745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B131
`Chr3:62354365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B62,B99,C35,C50,C74
`Chr3:62354381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B46,B95,C44,C81,D3
`Chr3:62354990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C9
`Chr3:62355548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:62355654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799458.1

2500 aa

1250

2500

TPR_ZFYVE26

PF25569 TPR_ZFYVE26 2378-2497 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799458.1`	Pfam	`PF25569`	TPR_ZFYVE26	Repeat	2378	2497	3.7e-32	111.9	ZFYVE26-like, TPR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943475.1
AACTGAACACTTTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTGCGCACAATACATGTACACTAGCTCGTTTCAGCAGAAGTTCCAATCATGGAAGACAAAGACACCGAGCTTCTCTCAAGAGTTGCCGCCAACCACTTATTCCTCGGCCAATTCGAGCCGTTTCGGGCCACGGTGCGCAGCCTCCGGGCTCGAAATCCGGACCTCGCCCGCACCATTCTACAGACGGTGGTCTCTCGGGGCGGCCGACTCGGCACGCCCGACCCGGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015200
ATGGAAGACAAAGACACCGAGCTTCTCTCAAGAGTTGCCGCCAACCACTTATTCCTCGGCCAATTCGAGCCGTTTCGGGCCACGGTGCGCAGCCTCCGGGCTCGAAATCCGGACCTCGCCCGCACCATTCTACAGACGGTGGTCTCTCGGGGCGGCCGACTCGGCACGCCCGACCCGGTCACGTGGTCCGATTCCTGCCCCTCGCCCGCGGACCTCACCTTCTTCTGCACCGTCGAATTGCTCCAGTTCCCCGACGCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799458.1
MEDKDTELLSRVAANHLFLGQFEPFRATVRSLRARNPDLARTILQTVVSRGGRLGTPDPVTWSDSCPSPADLTFFCTVELLQFPDATSNLWSFGPDMLKLRSEFLLYVHIVSSRILRTIEGGVIRNFDEGSARNEELRVLELLSELGLSRLRPDLTGSEETEEVGFGGLGELELMALRGSILENSDVYDVLCANIGEQVGCVVAEDSGGLAIALRKGRRRGEEKEEEVLRLVQKCVQTTHMDAMRQCLENGDEDGAILHV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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