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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004420`

染色体: Chr03 坐标: 62376905-62381174 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004420`
名称	SmilChr03G004420
描述	DDT domain-containing protein DDR4
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62376905 - 62381174 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015260`
GeneID	`131015260`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015260`
原始查询	`SmilChr03G004420`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DDT domain-containing protein DDR4
产物	DDT domain-containing protein DDR4
Arabidopsis	`AT1G18950` (AT1G18950) DDT domain superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838476] identity=40.3; qcov=0.79; evalue=2.08e-89; confidence=medium
Rice	`Os01g0180700` - identity=38.8; qcov=1.11; evalue=9.8e-98; confidence=medium
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0031213 (RSF complex)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015260

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799557.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057799557.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057799557.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799557.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799557.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62377062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr3:62377103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,D9
`Chr3:62377114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B85,C76
`Chr3:62377117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C87
`Chr3:62378305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B85,C76
`Chr3:62378584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B140,C40,C48
`Chr3:62379244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:62379246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr3:62379297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr3:62379473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B27,B90,B92
`Chr3:62379616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B140,C40,C48
`Chr3:62379841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C13

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943574.1
AGTGAAGGAGTTTAGGCGGGAAACCCAAAATTTTTCTGGATATTCTCATTCCATGGCCGGAGCTAACCCAATTCCTGCAAACGACGCCGCAGAGGGAGCGTCGGAGCCATCCCCGCCGAAAATGCCCGACGTCGACTCCGCCCGCACGAAGCTTCGCCAACGATGGGAGTTGGCTTCAGTTCTCAACTTCCTCCACGTATTCCATCCGATAATTGGTGGAGATCTGAAGTTATCCGCTGAAGATGTGGAAACTGCAATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015260
ATGGCCGGAGCTAACCCAATTCCTGCAAACGACGCCGCAGAGGGAGCGTCGGAGCCATCCCCGCCGAAAATGCCCGACGTCGACTCCGCCCGCACGAAGCTTCGCCAACGATGGGAGTTGGCTTCAGTTCTCAACTTCCTCCACGTATTCCATCCGATAATTGGTGGAGATCTGAAGTTATCCGCTGAAGATGTGGAAACTGCAATAATCGAGCAAAACAGTACACTTGCTAAGCTTCACATAGCACTCTTGAAGGGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799557.1
MAGANPIPANDAAEGASEPSPPKMPDVDSARTKLRQRWELASVLNFLHVFHPIIGGDLKLSAEDVETAIIEQNSTLAKLHIALLKGILPSSQVQTLKSSDAWMVALSKALSTWWPWVAEGDFPLTGAKGEEISIYKELEPTARVVILKALCEVRADQYDVASYISEQIKHGTDLSYFRKDKLASDGNRVAFWYDGNETIGHRLYKEVNFFEKRQAKNKDTVPAVNCQWETLATNLEEFNKIVNEFSSSKFKWEVALGKSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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