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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004446`

染色体: Chr03 坐标: 62594368-62598313 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004446`
名称	SmilChr03G004446
描述	protein tesmin/TSO1-like CXC 6
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62594368 - 62598313 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015252`
GeneID	`131015252`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015252`
原始查询	`SmilChr03G004446`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein tesmin/TSO1-like CXC 6
产物	protein tesmin/TSO1-like CXC 6
Arabidopsis	`AT2G20110` (AT2G20110) Tesmin/TSO1-like CXC domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816530] identity=38.7; qcov=0.887; evalue=5.99e-95; confidence=medium
Rice	`Os01g0761100` - identity=40.9; qcov=0.86; evalue=6.1e-87; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF03638 (TCR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015252

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799544.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799544.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799544.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799544.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799544.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62594724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr3:62594853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C43,D7
`Chr3:62594938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:62594942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:62594965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B125,B83
`Chr3:62595015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:62595228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B104,B127,C42,C78
`Chr3:62595621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:62595687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:62595688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr3:62596345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:62597087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B125,B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799544.1

515 aa

258

515

TCR

PF03638 TCR 146-182 aa PF03638 TCR 210-244 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799544.1`	Pfam	`PF03638`	TCR	Domain	146	182	9e-24	84.2	Tesmin/TSO1-like CXC domain, cysteine-rich domain
`XP_057799544.1`	Pfam	`PF03638`	TCR	Domain	210	244	9e-24	84.2	Tesmin/TSO1-like CXC domain, cysteine-rich domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943561.1
ACTCACACAGCACACAGCACAACTCAAATACTCCCTCTGCTTTCTCTCTCTAAAAAAAATCCCCAACCTCATTTTTTCTCATAGATTTCAAACCTATTAACTTCCCTTTGCGGAAAAGGAAGAAGATTTCAAATTTTCGTGGGAACGCGCACAAGAATCGAATCTGCATTCGTCTCCGAGAGCGGAATTTGACGATACGAGGAGGAGATTAGTGATTTTTGAGAGAGAAATATTTGAATTTTTGTCTTCTTTTGGTTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015252
ATGAGCATGGAGCAGAGAGAAGGGGCGGCGGCGCCGGTGGTAAGGCAGCTGGATTTCACGGTTAATTTCATGTCTGCGGCGGCGAATGCTAACGGCAAGGGGAGTCCGATGGATCAGTCACAGCCTAAGTGGCTGGCGGCGGGGAATTCGCAGCACGCGCATGCAATTGCAGGTTCTCCTCAGTCGCCGTCGCGAAGCCAGCTGGCGCAAACGAAATTTCCGCCGCGGAAAATGGTGATGCCGCCGAAGTCTCCGCATCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799544.1
MSMEQREGAAAPVVRQLDFTVNFMSAAANANGKGSPMDQSQPKWLAAGNSQHAHAIAGSPQSPSRSQLAQTKFPPRKMVMPPKSPHRELPQMEVRAQSPLIAPRLSHPVGKPVPTPKRALQPLMKMESPKSRERNPEQNDGTLKKQKQCRCKNSRCLKLYCECFSSGVYCDGCNCINCHNKKENEADRKEAIDAVLERKPDAFYGVEHSRGCNCKRTGCLKKYCECFQANIPCSDKCKCIDCKNFEGCEERKARLYHHSA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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