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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004450`

染色体: Chr03 坐标: 62632775-62637431 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004450`
名称	SmilChr03G004450
描述	probable tocopherol cyclase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62632775 - 62637431 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015255`
GeneID	`131015255`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015255`
原始查询	`SmilChr03G004450`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable tocopherol cyclase, chloroplastic
产物	probable tocopherol cyclase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G32770` (VTE1) tocopherol cyclase, chloroplast / vitamin E deficient 1 (VTE1) / sucrose export defective 1 (SXD1) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829413] identity=64.1; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0276500` (OsVTE1) - identity=70.4; qcov=0.862; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009976 (tocopherol cyclase activity)
KEGG	smil00130 (Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF14249 (Tocopherol_cycl)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015255

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057799551.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057799551.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057799551.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799551.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799551.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62632955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B140,B32,C31,C8
`Chr3:62632978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,C1,C33,C57,C65
`Chr3:62633038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr3:62633101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,C1,C33,C57,C65
`Chr3:62633696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C56
`Chr3:62634467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B76,B98,C86
`Chr3:62634515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,C1,C33,C57,C65
`Chr3:62634520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,C1,C33,C57,C65
`Chr3:62634808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,C1,C33,C57,C65
`Chr3:62635671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr3:62635932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C59
`Chr3:62636585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B13,B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799551.1

494 aa

247

494

Tocopherol_cycl

PF14249 Tocopherol_cycl 96-452 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799551.1`	Pfam	`PF14249`	Tocopherol_cycl	Family	96	452	1.5e-141	472.0	Tocopherol cyclase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943568.1
ACAAAAAAAAATAAAAAAAATCCGCATTATGTGATCACCGATGATGGTTTATTCCGCCACGTCAACCCATTTCCAGCAGTCGACTACAAGTGTCGCCGCCGCGCCACCTTCCGCCACACACACTCACACTTCACACACTCCGCTCCGTGAGCTCGACCAATGGAGAATCTCTCTGCAATCGCCAGAAATCCTTGCCTTAATTCGTCGTCTCTCCGTCCTAGAACTGCCACAGCACTTCCGTTTTCTCCGGCGGAGCTGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015255
ATGGAGAATCTCTCTGCAATCGCCAGAAATCCTTGCCTTAATTCGTCGTCTCTCCGTCCTAGAACTGCCACAGCACTTCCGTTTTCTCCGGCGGAGCTGCCGTTCGGGAAAATTTCGCGGCGGCGTTTTGCGGTGAAAGCTGCGTTGAATACCGACACGGTTAATCGGCCAATCGCTAATGAGAATGGCAACGAGGTTGATAGTGCCGAACCTTTTTACGAACGCACGCCTCGCAACCGCCCCCTCCGAACCCCTCACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799551.1
MENLSAIARNPCLNSSSLRPRTATALPFSPAELPFGKISRRRFAVKAALNTDTVNRPIANENGNEVDSAEPFYERTPRNRPLRTPHSGFHFDGTARKFFEGWYFKVSIPECRQSFCFMYSLENPAFTKKLGRLEEAQYGPRSTGVGAQILGADDKYICQFSEESKNFWGDRHELMLGSTFALQKNMQPPKREIPPQEFNKRVLEGFQVTPLWHQGSIRDDGRNDFAEIVKTARWAYSTRPVYGWGNVGSKQKSTAGWLAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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