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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004462`

染色体: Chr03 坐标: 62695383-62699201 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004462`
名称	SmilChr03G004462
描述	exosome complex exonuclease RRP46 homolog
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62695383 - 62699201 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015297`
GeneID	`131015297`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015297`
原始查询	`SmilChr03G004462`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	exosome complex exonuclease RRP46 homolog
产物	exosome complex exonuclease RRP46 homolog
Arabidopsis	`AT3G46210` (AT3G46210) Ribosomal protein S5 domain 2-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823766] identity=65.4; qcov=1; evalue=5.63e-118; confidence=high
Rice	`Os03g0854200` (RRP46) - identity=58; qcov=0.979; evalue=4.81e-97; confidence=high
GO	GO:0000176 (nuclear exosome (RNase complex)); GO:0000177 (cytoplasmic exosome (RNase complex)); GO:0005730 (nucleolus); GO:0016075 (rRNA catabolic process); GO:0034427 (GO:0034427); GO:0034475 (U4 snRNA 3'-end processing); GO:0071028 (nuclear mRNA surveillance); GO:0071051 (poly(A)-dependent snoRNA 3'-end processing)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01138 (RNase_PH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015297

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799630.1`
2	Nucleolus	核仁	0.80000	`XP_057799630.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057799630.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057799630.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057799630.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62695720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B86,C53,C80
`Chr3:62695928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:62696403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:62696420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B60,C23,C42,C62
`Chr3:62696437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C13,C4
`Chr3:62696449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C31
`Chr3:62696833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr3:62697157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr3:62697166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr3:62697167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,C77,C86
`Chr3:62697168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:62697589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799630.1

243 aa

122

243

RNase_PH

PF01138 RNase_PH 13-133 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799630.1`	Pfam	`PF01138`	RNase_PH	Domain	13	133	8.4e-26	91.6	3' exoribonuclease family, domain 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943647.1
AGTGCGATTTTAGCCTCTTATACCATTCATCTTCCCCGTTAAACCCTTGCTTCGAAAACCCTAGATTTTGACCTTCACTTTCAGAGAATTTTTTGTTAAATCTTCAAATTGATCTTCAATTTGTGCTTGGAAAATTTAGAGAGAGAGAGAGCAGAACGATGGAATTAGAGAGAGTAGGCGGGCGTGGAGCCAACCAGTTGAGACCGATTGACTGTGCTCGCGACGTTCTCAGCCGCGCCCATGGCTCCGCCAGTTGTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015297
ATGGAATTAGAGAGAGTAGGCGGGCGTGGAGCCAACCAGTTGAGACCGATTGACTGTGCTCGCGACGTTCTCAGCCGCGCCCATGGCTCCGCCAGTTGTTCTCATGGAGAGACTAGGGTGCTTGCTGCTGTTTTCGGACCTAAAGCTGGGACGAAGAAGAATGAGAACCCCGAGAAAGCTTGCATTGAAGTCATTTGGAAAGCCAAAACGGGGCCAATTGGAAAAACTGAAAAGGAGTTTGAGATGATATTGAAGAGAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799630.1
MELERVGGRGANQLRPIDCARDVLSRAHGSASCSHGETRVLAAVFGPKAGTKKNENPEKACIEVIWKAKTGPIGKTEKEFEMILKRTLQNICLLTVHPNTTTSIVVQVVHDDGSVLPCAIHASCAALVDAGIPLKSLAVSLCCCLTESGNIILDPSKLEEQTMKAFVCLVFPSSVHSILPEESTHASSKSTEQEIITSLTHGVMTVDDYFHCVEQGRAAIAPLSNILKKKMRSQSAGNSSKAG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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