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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004468`

染色体: Chr03 坐标: 62756420-62758985 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004468`
名称	SmilChr03G004468
描述	pectin acetylesterase 11-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62756420 - 62758985 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015317`
GeneID	`131015317`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015317`
原始查询	`SmilChr03G004468`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectin acetylesterase 11-like
产物	pectin acetylesterase 11-like
Arabidopsis	`AT5G45280` (AT5G45280) Pectinacetylesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834564] identity=37.9; qcov=0.965; evalue=2.36e-100; confidence=medium
Rice	`Os02g0702400` - identity=39.9; qcov=0.947; evalue=1.35e-94; confidence=medium
GO	GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0052793 (pectin acetylesterase activity); GO:0071555 (cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF03283 (PAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015317

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057799656.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799656.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799656.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799656.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799656.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62756656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C19
`Chr3:62756764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr3:62756813`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A21,A24,B115,B70,B91,C61
`Chr3:62756867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,C56
`Chr3:62756971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B59,C77
`Chr3:62756980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B53,B71,C24
`Chr3:62756985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B124,C70
`Chr3:62757003`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A5,B13,B66,B8,B80,C22,C77
`Chr3:62757060`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B111,B90,B92
`Chr3:62757060`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B111,B90,B92
`Chr3:62757291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B53,B71
`Chr3:62757300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	40	A20,A8,B1,B105,B111,B119,B122,B13,B138,B17,B2,B22,B24,B40,B59,B60,B62,B65,B67,B8,B87,B88,B90,B92,C17,C25,C30,C40,C43,C44,C45,C49,C5,C51,C54,C62,C71,C8,C84,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799656.1

397 aa

198

397

PAE

PF03283 PAE 24-386 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799656.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	24	386	1.2e-113	380.6	Pectinacetylesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943673.1
AATAATGCATCATCCCTTCACAATTCCTCACACCTCAAACAACTCTCTCTCATCTCTCTCACTTCACTCTCTCACTCTCTCTATCTCTCTCTCACTTGACTCTCTCTCTCTCTCTAAGCTATTGTGATGGCGACGATGTGGATGATTGTGTGTGCGATAATTTTGGTGATGGTCGGCGGCGAGCAGCCGGCATGCGACAAGGTCCCCTTCACTCCACTTCTCAACGCTACTCAGAAAGGAGCAGTTTGCGTTGACGGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015317
ATGGCGACGATGTGGATGATTGTGTGTGCGATAATTTTGGTGATGGTCGGCGGCGAGCAGCCGGCATGCGACAAGGTCCCCTTCACTCCACTTCTCAACGCTACTCAGAAAGGAGCAGTTTGCGTTGACGGCTCACCCGACGGCTACTATCTGCAGCCGGGATCAGGAGACGGAGCCAAAAACTGGCTCATCTATATCAATGGAGGCGGGTGGTGTGAAAACATTACTACCTGTCGTGATAGATTTAACGAATACAATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799656.1
MATMWMIVCAIILVMVGGEQPACDKVPFTPLLNATQKGAVCVDGSPDGYYLQPGSGDGAKNWLIYINGGGWCENITTCRDRFNEYNGNSRISFSNIPNSNGTLSVAKDFTGILSQNQAINPDFYNWNRIYVTYCDQASFLGDTVVDDGQGPIVQFRGSRNFDALVEDLLAKGIGAGENVILSGRSAGGLATILHCDGFRARLPNVGRVKCLSDAGFFIRAENVANADYRDQFFASVIQLHNISSLLPATCTQIRDPSLCL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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