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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004476`

染色体: Chr03 坐标: 62872153-62873653 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004476`
名称	SmilChr03G004476
描述	receptor kinase-like protein Xa21
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62872153 - 62873653 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019146`
GeneID	`131019146`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019146`
原始查询	`SmilChr03G004476`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor kinase-like protein Xa21
产物	receptor kinase-like protein Xa21
Arabidopsis	`AT3G47570` (AT3G47570) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823911] identity=37.5; qcov=1.17; evalue=7.56e-99; confidence=medium
Rice	`Os11g0208900` - identity=43.9; qcov=1; evalue=1.92e-109; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019146

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057803815.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803815.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803815.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803815.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803815.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62872159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr3:62872160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,C40,D6
`Chr3:62872321`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A8,B113,B17,B73,C20,C25,C51,C52,D9
`Chr3:62872359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B25,C21,C41,C84
`Chr3:62872387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C68
`Chr3:62872404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B65,C20
`Chr3:62872421`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B78
`Chr3:62872421`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B78
`Chr3:62872444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:62872447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,D10
`Chr3:62872470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C49
`Chr3:62872471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B2,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803815.1

448 aa

224

448

LRR_1

LRR_8

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00560 LRR_1 15-36 aa PF00560 LRR_1 39-61 aa PF00560 LRR_1 64-85 aa PF13855 LRR_8 111-170 aa PF00560 LRR_1 135-156 aa PF00069 Pkinase 279-445 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 281-429 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803815.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	15	36	5.9e-16	55.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057803815.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	39	61	5.9e-16	55.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057803815.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	64	85	5.9e-16	55.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057803815.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	111	170	3.4e-14	53.1	Leucine rich repeat
`XP_057803815.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	135	156	5.9e-16	55.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057803815.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	279	445	8.6e-31	108.0	Protein kinase domain
`XP_057803815.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	281	429	1.3e-27	97.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947832.1
TTTTCAAGATAACATGTTGGGAGGCTCAATACCACATGCTATATGTGATCTATTCAGCCTCAATACTTTAGTTATGAGCAAGAATCAATTTTCAGGCCCAATTCCTAAATGTTTGGGAAATGTCTCTTCTTTAAGAAATCTTTATCTAGAATCCAACATGTTGAATTCAAGCATACCTTCAAGCTTATGGGGTCTAAAAGATTTGAACTCTCTAGACTTGTCCTCAAATTCATTAAATGGGTCACTACCTCTAGAGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019146
ATGTTGGGAGGCTCAATACCACATGCTATATGTGATCTATTCAGCCTCAATACTTTAGTTATGAGCAAGAATCAATTTTCAGGCCCAATTCCTAAATGTTTGGGAAATGTCTCTTCTTTAAGAAATCTTTATCTAGAATCCAACATGTTGAATTCAAGCATACCTTCAAGCTTATGGGGTCTAAAAGATTTGAACTCTCTAGACTTGTCCTCAAATTCATTAAATGGGTCACTACCTCTAGAGATGAGTAGCTTAGGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803815.1
MLGGSIPHAICDLFSLNTLVMSKNQFSGPIPKCLGNVSSLRNLYLESNMLNSSIPSSLWGLKDLNSLDLSSNSLNGSLPLEMSSLGEAIYINVAMNKLSGSIPSTIGKLQNLVNLSLANNRLEGYMPVSMGSMISLANLDLSYNNLSGSIPKSLEALQHLDYFNVSFNSLSGEIPNGGSFRNFTMDCFKGNEALCGIPKFHVQICSSISNHISKRKKVERASFIVFGVVAFISVVSLAFIIVRNKRKDKTTREVDELIFI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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