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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004492`

染色体: Chr03 坐标: 63034100-63034822 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004492`
名称	SmilChr03G004492
描述	uncharacterized SmilChr03G004492
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63034100 - 63034822 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019155`
GeneID	`131019155`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019155`
原始查询	`SmilChr03G004492`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsFbox008; symbol=OsFbox008; hit=Os01g0327900; species=rice; confidence=weak
产物	OsFbox008; symbol=OsFbox008; hit=Os01g0327900; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G53780` (AT5G53780) F-box protein, putative (DUF295) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835459] identity=24.1; qcov=0.846; evalue=8.89e-07; confidence=weak
Rice	`Os01g0327900` (OsFbox008) - identity=24.6; qcov=0.933; evalue=6.78e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03478 (Beta-prop_KIB1-4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019155

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803824.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803824.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803824.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803824.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803824.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63034132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr3:63034139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr3:63034140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C23,C42,C62
`Chr3:63034164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:63034175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr3:63034205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,C73,D2
`Chr3:63034236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:63034238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B137,B21,B78,B86
`Chr3:63034261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B60,C42,C62
`Chr3:63034261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,C42,C62
`Chr3:63034281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,D7
`Chr3:63034286`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	39	A10,A11,A18,A19,A21,A23,A4,B104,B114,B125,B131,B133,B139,B25,B30,B31,B38,B39,B46,B58,B59,B61,B62,B67,B7,B88,C19,C20,C23,C31,C32,C41,C62,C64,C68,C77,C8,D4,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803824.1

240 aa

120

240

Beta-prop_KIB1-4

PF03478 Beta-prop_KIB1-4 24-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803824.1`	Pfam	`PF03478`	Beta-prop_KIB1-4	Repeat	24	208	3.5e-27	96.2	KIB1-4 beta-propeller

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947841.1
ATGGCTTTTCCCCCATTCCTCATGCTTCCCCTCCTCGACCAAAACACCCAAGAAATCAATGGCCTCTCTCTCTACAGCCTCAAAGACAAGAAACCCCTCAACCTCGGATTCCTCGAAAACCTCAGAAACCCCCAATGCGTGGGGTCTTCCCACGGCTGGCTAGCTTTCTTGGACGAAAAAGCAAACCCTTTTCTCCTCAACCCCTTCACCAAAGCCCTAATCCATCTCCCTCCAAAACCATCCAAGATTTCCAAACTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019155
ATGGCTTTTCCCCCATTCCTCATGCTTCCCCTCCTCGACCAAAACACCCAAGAAATCAATGGCCTCTCTCTCTACAGCCTCAAAGACAAGAAACCCCTCAACCTCGGATTCCTCGAAAACCTCAGAAACCCCCAATGCGTGGGGTCTTCCCACGGCTGGCTAGCTTTCTTGGACGAAAAAGCAAACCCTTTTCTCCTCAACCCCTTCACCAAAGCCCTAATCCATCTCCCTCCAAAACCATCCAAGATTTCCAAACTAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803824.1
MAFPPFLMLPLLDQNTQEINGLSLYSLKDKKPLNLGFLENLRNPQCVGSSHGWLAFLDEKANPFLLNPFTKALIHLPPKPSKISKLILSKNPSSHPNTYAAVAMQTNLSFCRNGDAAWRLLDGQGKTYYDVVCCSETNTLFALAPGPRVESWDLNEASPKKTMIIEGSCPRMLQLALKNFPVDLYSSQWYLALSPAGEIFMAVRYIGEFVNGDGEAVYEGDTLTDYMAAPLVCPYPATSF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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