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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004507`

染色体: Chr03 坐标: 63167632-63172830 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004507`
名称	SmilChr03G004507
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63167632 - 63172830 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015438`
GeneID	`131015438`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015438`
原始查询	`SmilChr03G004507`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
Arabidopsis	`AT3G47570` (AT3G47570) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823911] identity=46.8; qcov=0.911; evalue=1.09e-50; confidence=medium
Rice	`Os04g0213800` (OsRLCK137) - identity=50.5; qcov=0.793; evalue=7.76e-61; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015438

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057799826.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057799826.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799826.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799826.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799826.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63169951`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B28,B56,B96,D10
`Chr3:63169951`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B28,B56,B96,D10
`Chr3:63169964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr3:63169998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C81
`Chr3:63170020`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A18,B98,C22
`Chr3:63170020`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A18,B98,C22
`Chr3:63170022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B98,C17,C22
`Chr3:63170032`	`GAC`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B109,B118,B86,C80
`Chr3:63170034`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B4,B41,C32,C46,C55
`Chr3:63170034`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B4,B41,C32,C46,C55
`Chr3:63170036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B4,B41,C32,C46,C55
`Chr3:63170046`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799826.1

237 aa

118

237

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 26-193 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 28-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799826.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	26	193	7.2e-31	108.3	Protein kinase domain
`XP_057799826.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	28	177	7.9e-28	98.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943843.1
GGCAAAGTTAGCTAATGAAGTCTTCTTCATTTGGTGGCTTTGATGAGGCATGCAGTGGATAGTTGTGAGGTGGATGACATAAAGAATGGAAAATGTTGTTCTTTATTATTACCATGGAAGAAAGAATCTCTTATTATGAACTGCTGCAAGCAACAGAAAGATTCGATGAAAGCAATTTACTTGGCACTGGGAGTTCTTGCTCTGTTTATAAAGGAATTCTTAACAATGGGAAGGATATCGTTGTCAAGGTGTTTAATATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015438
ATGTTGTTCTTTATTATTACCATGGAAGAAAGAATCTCTTATTATGAACTGCTGCAAGCAACAGAAAGATTCGATGAAAGCAATTTACTTGGCACTGGGAGTTCTTGCTCTGTTTATAAAGGAATTCTTAACAATGGGAAGGATATCGTTGTCAAGGTGTTTAATATGCAGCTAGAAGGTATTTCAAGAATATTTGATGTCGAATGTGAGATACTACGTAGCATTCGACACAGGAATCTGACAAGCGTCATAAGCAGTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799826.1
MLFFIITMEERISYYELLQATERFDESNLLGTGSSCSVYKGILNNGKDIVVKVFNMQLEGISRIFDVECEILRSIRHRNLTSVISSCSNEEFKALVLEYMPKGNLEKWLYSHSYCLNMMERLNIMIDVASALEYLHHGYSMPIVHSDLKPSNVLLDEDMVAHVSDFGIAKLLCDGDSFVLTNTLATFGYIAPGEVSLNILIALHFQSINCVFLTAHIMIFVVPEYGLEGLVSTRCDV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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