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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004508`

染色体: Chr03 坐标: 63170609-63176044 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004508`
名称	SmilChr03G004508
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63170609 - 63176044 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015420`
GeneID	`131015420`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015420`
原始查询	`SmilChr03G004508`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
Arabidopsis	`AT3G47090` (AT3G47090) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823862] identity=41.3; qcov=1.05; evalue=6.11e-75; confidence=medium
Rice	`Os01g0694000` - identity=45.1; qcov=0.977; evalue=1.15e-89; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015420

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057799790.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057799790.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057799790.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799790.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799790.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63172911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,C16,C29,C35
`Chr3:63172933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B115,B70,B91,C61
`Chr3:63172994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B55,B74,C75
`Chr3:63173030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B11,B133,B45,D8
`Chr3:63173036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C52,C57,C60
`Chr3:63173083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B92
`Chr3:63173155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr3:63173192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B59,B70,D3
`Chr3:63173195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,B77,C4,C52
`Chr3:63173214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B86,C75
`Chr3:63173230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C32
`Chr3:63173234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799790.1

306 aa

153

306

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 26-294 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 28-297 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799790.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	26	294	2.1e-40	139.5	Protein kinase domain
`XP_057799790.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	28	297	3.1e-40	138.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943807.1
GTGGCTTTGATGAGGCATGCAGTGGATAGTTGTGAGGTGGATGACATAAAGAATGGAAAATGTTGTTCTTTATTATTACCATGGAAGAAAGAATCTCTTATTATGAACTGCTGCAAGCAACAGAAAGATTCGATGAAAGCAATTTACTTGGCACTGGGAGTTCTTGCTCTGTTTATAAAGGAATTCTTAACAATGGGAAGGATATCGTTGTCAAGGTGTTTAATATGCAGCTAGAAGGTATTTCAAGAATATTTGATGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015420
ATGTTGTTCTTTATTATTACCATGGAAGAAAGAATCTCTTATTATGAACTGCTGCAAGCAACAGAAAGATTCGATGAAAGCAATTTACTTGGCACTGGGAGTTCTTGCTCTGTTTATAAAGGAATTCTTAACAATGGGAAGGATATCGTTGTCAAGGTGTTTAATATGCAGCTAGAAGGTATTTCAAGAATATTTGATGTCGAATGTGAGATACTACGTAGCATTCGACACAGGAATCTGACAAGCGTCATAAGCAGTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799790.1
MLFFIITMEERISYYELLQATERFDESNLLGTGSSCSVYKGILNNGKDIVVKVFNMQLEGISRIFDVECEILRSIRHRNLTSVISSCSDEEFKALVLEYMPKGNLEKWLYSHSYCLNMMERLNIMIDVASALEYLHHGYSMPIVHSDLKPSNVLLDEDMVAHVSDFGIAKLLCDGDSFVLTNTLATFGYIAPEYGLEGLVSTRCDVYSYGVMLIETFTRKRPSDDMFCGDMSLKRWVELSLSEIPDEVIDANLVMNLEEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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