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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004522`

染色体: Chr03 坐标: 63280956-63286000 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004522`
名称	SmilChr03G004522
描述	protein unc-13 homolog
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63280956 - 63286000 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015327`
GeneID	`131015327`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015327`
原始查询	`SmilChr03G004522`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein unc-13 homolog
产物	protein unc-13 homolog
Arabidopsis	`AT2G25800` (AT2G25800) elongation factor Ts (DUF810) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817122] identity=72.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0346700` (P0512H04.9-1) - identity=64.1; qcov=0.961; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25761 (TPR_PATROL1); PF27629 (UNC13_3rd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015327

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.60000	`XP_057799666.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057799666.1`
3	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.40000	`XP_057799666.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057799666.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057799666.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63281221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,D6
`Chr3:63281235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B140
`Chr3:63281342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,C43
`Chr3:63281378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr3:63281381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:63281409`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B113
`Chr3:63281409`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B113
`Chr3:63281457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:63281533`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B27,B93
`Chr3:63281533`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B27,B93
`Chr3:63281571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B93,C37
`Chr3:63282661`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799666.1

1001 aa

500

1001

UNC13_3rd

TPR_PATROL1

PF27629 UNC13_3rd 344-446 aa PF25761 TPR_PATROL1 603-1000 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799666.1`	Pfam	`PF27629`	UNC13_3rd	Domain	344	446	7.8e-23	81.7	UNC13 third domain
`XP_057799666.1`	Pfam	`PF25761`	TPR_PATROL1	Repeat	603	1000	2.7e-172	574.0	PATROL1-like, TPR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943683.1
ATTTGAAACGGGAAATAAATCTATCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAGTTTTACTTTTTCTGACTCAAACTTCTCTCCTTTCTCTCTCTACACAGAGCGACAATGGCGTCTCTCTTCAGAGACCGAACCCTCGGCCACTCCAAGAGAGACTCCTTCTCCTCCTCCTCGTCCATCACCACCGCCGCCGCCACCGCCTCTCCTTCCTCCGCCACCTCCCGCTTCACCCCCGCCGCCAATTCCACCGCTCTAACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015327
ATGGCGTCTCTCTTCAGAGACCGAACCCTCGGCCACTCCAAGAGAGACTCCTTCTCCTCCTCCTCGTCCATCACCACCGCCGCCGCCACCGCCTCTCCTTCCTCCGCCACCTCCCGCTTCACCCCCGCCGCCAATTCCACCGCTCTAACCCCTCTCCCCTTCCCATTCGGCGACCTAACCCCCACACTCTCCGATGCCGACCTCCGCGCCACCGCCTACGAGATCTTCGTCTCCGCCAACCGCTCCTCCTCCTCCAAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799666.1
MASLFRDRTLGHSKRDSFSSSSSITTAAATASPSSATSRFTPAANSTALTPLPFPFGDLTPTLSDADLRATAYEIFVSANRSSSSKPLTYIPSSNGHSNSPNSSGSNGHSNANLQRSLTSAAASKMKKALGMRSTSSKRSSDSGNSGAGGKVKKPVTIGELMRIQMRVSEAADSRIRRGLLRISAGQVGRRNESMILPLELLQQFKASDFTDQDEYEAWQKRNLRMLEAGLLLHPHMPLEKGNTAAQRLRQIIQAALDRP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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