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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004525`

染色体: Chr03 坐标: 63300237-63301258 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004525`
名称	SmilChr03G004525
描述	uncharacterized SmilChr03G004525
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63300237 - 63301258 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015437`
GeneID	`131015437`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015437`
原始查询	`SmilChr03G004525`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P0427B07.42; symbol=P0427B07.42; hit=Os06g0554100; species=rice; confidence=high
产物	P0427B07.42; symbol=P0427B07.42; hit=Os06g0554100; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G11620` (AT5G11620) SWIM zinc finger family protein / mitogen-activated protein kinase kinase kinase (MAPKKK)-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831034] identity=43.5; qcov=1.11; evalue=1.37e-61; confidence=medium
Rice	`Os06g0554100` (P0427B07.42) - identity=53.5; qcov=0.942; evalue=1.31e-71; confidence=high
GO	GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM); PF13639 (zf-RING_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015437

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799825.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799825.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799825.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799825.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799825.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63300381`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B130,B71
`Chr3:63300388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr3:63300467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B124,B40,B72,C48
`Chr3:63300517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B115,B21,B59,C8
`Chr3:63300581`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B18
`Chr3:63300581`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B18
`Chr3:63300586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B12,B122,B140
`Chr3:63300650`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B117,D7
`Chr3:63300650`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B117,D7
`Chr3:63300663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A9,C33,C65
`Chr3:63300670`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	58	A14,A16,A23,A5,A7,B101,B103,B109,B121,B127,B129,B138,B139,B17,B2,B27,B57,B58,B60,B62,B65,B71,B78,B8,B81,B83,B86,B9,B93,B95,C10,C18,C2,C24,C25,C26,C29,C30,C34,C45,C46,C5,C53,C54,C55,C60,C65,C7,C71,C74,C76,C79,C80,C82,C85,C87,D11,D7
`Chr3:63300672`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	43	A11,A15,A2,A22,A25,A3,A9,B1,B100,B106,B11,B119,B125,B133,B15,B22,B23,B26,B37,B4,B45,B50,B67,B69,B70,B73,B74,B87,C15,C22,C27,C33,C36,C4,C40,C41,C49,C51,C61,C63,C70,C9,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799825.1

240 aa

120

240

SWIM

zf-RING_2

PF04434 SWIM 58-86 aa PF13639 zf-RING_2 160-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799825.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	58	86	5.3e-07	29.7	SWIM zinc finger
`XP_057799825.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	160	208	5.3e-06	27.3	Ring finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943842.1
CCCAAAGCATATCTCTAAGCCCAAATTTCTATTACCAAAAATACCAAATTCGGACACCAATAGGCAATAACTACCATAATATCTCTCCTCGTTTTATCCATAACCGCCATATATAACCGCCACTTTCCCGCCCCCACTTCCCCGCCGCCGTCCGATGGAGTCCGTCGCCTCGAGCTCCACCCCCCGCCGCCCGCTCCACCACCGCCCCCGCCCCGACGTCGCGCAATCCTTCTCCGACCGCATCATCCGCGCCGTCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015437
ATGGAGTCCGTCGCCTCGAGCTCCACCCCCCGCCGCCCGCTCCACCACCGCCCCCGCCCCGACGTCGCGCAATCCTTCTCCGACCGCATCATCCGCGCCGTCCGCCACCGCCTCCGACTCCTCCACCGCTCCGGCCCCCTCTTCTCCGTCCTCGGCGCCACCGGCAACGTCTACACCGTCACCATCTCCGCCACCGTGTCGTGCTCGTGCCCCGACCGCGCCACCCCGTGCAAGCACATCCTCTTCGTCTACATCCGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799825.1
MESVASSSTPRRPLHHRPRPDVAQSFSDRIIRAVRHRLRLLHRSGPLFSVLGATGNVYTVTISATVSCSCPDRATPCKHILFVYIRVLGLPLDDPCLWRRSLRPCQFRRILGLPTAGDTLAGAALRERFHQLSSAQSRGGASGGDGGARRPEVAAEVGAACPVCLEEMAGEGAKVVACGACKNVIHEECFLAWKRSCRRRSATCVLCRARWRSGGDDLDKYLNLSAYVNEDDMMEDGGCS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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