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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004532`

染色体: Chr03 坐标: 63364544-63365368 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004532`
名称	SmilChr03G004532
描述	aspartyl protease AED3-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63364544 - 63365368 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019171`
GeneID	`131019171`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019171`
原始查询	`SmilChr03G004532`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease AED3-like
产物	aspartyl protease AED3-like
Arabidopsis	`AT5G07030` (AT5G07030) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830594] identity=67.7; qcov=0.914; evalue=8.7e-40; confidence=medium
Rice	`Os07g0658600` (P0047B07.135) - identity=66.7; qcov=0.943; evalue=2.41e-38; confidence=medium
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF14541 (TAXi_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019171

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057803839.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803839.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803839.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803839.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803839.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63364550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B38,C31,C75
`Chr3:63364559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,C25,D7
`Chr3:63364561`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A20,B10,B104,B105,B106,B111,B126,B129,B26,B4,B78,B81,B84,B86,B9,C29,C37,C50,C51,C53,C65,C72,C79,C82,D4
`Chr3:63365002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B18,B65,C77
`Chr3:63365002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B65,C77
`Chr3:63365056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr3:63365076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B120,B133
`Chr3:63365077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B32,B33,B47,C66
`Chr3:63365089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr3:63365110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B46,C5
`Chr3:63365117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C75
`Chr3:63365126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B76,B96,C21,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803839.1

105 aa

105

TAXi_C

PF14541 TAXi_C 46-102 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803839.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	46	102	2.9e-12	47.4	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947856.1
ATGGCACTATTTAGTGCCACAAATCTCGGCTACAAGTCCGTCAATTTCGCCGGTTCACTGAGGCTCGGGCCCAACAGCCAGCCCAAGAGAATCAAAACCACCCAACTTTTGAAGAACCCTAGAAGATTGTCTCTCTACTATGTCAATCTCCTCGCCATCAGAGTCGGGAGAAAGGTCGTCGCAATTCCTCCCTCTGTCTTCGCCTTCGATCACAACACCGGTGCCGGCACCGTTTTCGATTCAGGCACGGTGTTCACGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019171
ATGGCACTATTTAGTGCCACAAATCTCGGCTACAAGTCCGTCAATTTCGCCGGTTCACTGAGGCTCGGGCCCAACAGCCAGCCCAAGAGAATCAAAACCACCCAACTTTTGAAGAACCCTAGAAGATTGTCTCTCTACTATGTCAATCTCCTCGCCATCAGAGTCGGGAGAAAGGTCGTCGCAATTCCTCCCTCTGTCTTCGCCTTCGATCACAACACCGGTGCCGGCACCGTTTTCGATTCAGGCACGGTGTTCACGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803839.1
MALFSATNLGYKSVNFAGSLRLGPNSQPKRIKTTQLLKNPRRLSLYYVNLLAIRVGRKVVAIPPSVFAFDHNTGAGTVFDSGTVFTILVKPVYVAVRDEVAGSCG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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