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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004534`

染色体: Chr03 坐标: 63374796-63378309 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004534`
名称	SmilChr03G004534
描述	caffeoylshikimate esterase
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63374796 - 63378309 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015392`
GeneID	`131015392`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015392`
原始查询	`SmilChr03G004534`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	caffeoylshikimate esterase
产物	caffeoylshikimate esterase
Arabidopsis	`AT5G11650` (AT5G11650) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831037] identity=70; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0199400` (B1046G12.33-1) - identity=66.1; qcov=0.941; evalue=1.61e-174; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0016298 (lipase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015392

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057799756.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057799756.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057799756.1`
4	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057799756.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799756.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63374925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B48,B76,C11,C40,C69
`Chr3:63375028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B47,C19,C62
`Chr3:63375061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B47,C19,C62
`Chr3:63375199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:63377044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr3:63377503`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	156	A1,A10,A11,A13,A16,A18,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A5,A8,B10,B100,B102,B105,B106,B108,B110,B111,B112,B114,B118,B119,B120,B121,B123,B125,B126,B127,B128,B130,B131,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B14,B15,B18,B21,B22,B24,B25,B26,B28,B29,B3,B30,B32,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B46,B47,B50,B51,B53,B55,B58,B61,B64,B66,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B80,B81,B85,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B97,B99,C1,C11,C12,C14,C15,C17,C19,C20,C21,C22,C23,C26,C27,C28,C29,C31,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C50,C51,C52,C55,C57,C58,C59,C6,C62,C63,C64,C66,C67,C69,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C81,C83,C85,C86,C9,D1,D10,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr3:63377505`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	155	A1,A10,A11,A13,A16,A18,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A5,A8,B10,B100,B102,B105,B106,B108,B110,B111,B112,B114,B118,B119,B120,B121,B123,B125,B126,B127,B128,B130,B131,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B14,B15,B18,B21,B22,B24,B25,B26,B28,B29,B3,B30,B32,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B46,B47,B50,B51,B53,B55,B58,B61,B64,B66,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B80,B81,B85,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B97,B99,C1,C11,C12,C14,C15,C17,C19,C20,C21,C22,C23,C26,C27,C28,C29,C31,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C50,C52,C55,C57,C58,C59,C6,C62,C63,C64,C66,C67,C69,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C81,C83,C85,C86,C9,D1,D10,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr3:63377527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B67,C40
`Chr3:63377553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B65
`Chr3:63377813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B98,C33
`Chr3:63377861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:63377864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,A25,C78,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799756.1

405 aa

202

405

Hydrolase_4

Abhydrolase_1

Abhydrolase_6

PF12146 Hydrolase_4 139-377 aa PF00561 Abhydrolase_1 143-356 aa PF12697 Abhydrolase_6 144-351 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799756.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	139	377	5.4e-73	245.9	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057799756.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	143	356	8.1e-15	55.9	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057799756.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	144	351	3.5e-14	54.7	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943773.1
AAAATTCTACCACCAATTCTCTCCGTAGACCTCCGCTTCAATTTTCTCTCTCCACACCATTCCATACATAGACGACGAATAATTGCACTCATTTTCACCGCGAAAAGAGGAAGAGAGAAATGGACGCGGCGGCGGCGGCGGTGCCGGTGGAGGAGCTAACATCCGGCGCGAGCGGCCGCATAATTCCGGTCTTCAAAAACCTCCGTCAGTCGATCCTCTCATACGAGTCTCTGCGCAGATCGCTCCTGCTAATCTATTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015392
ATGGACGCGGCGGCGGCGGCGGTGCCGGTGGAGGAGCTAACATCCGGCGCGAGCGGCCGCATAATTCCGGTCTTCAAAAACCTCCGTCAGTCGATCCTCTCATACGAGTCTCTGCGCAGATCGCTCCTGCTAATCTATTCATTTTTCGTGTGGATCCTGCTCCTCCTTCCTCGCCTCCACCGAATTTCCGCCGCCGCCTCGCCGCCGTCCTCGCCGCGAACGGCGTCCGCGTCGGTCAGGCGTCGGAAATTCGGCGTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799756.1
MDAAAAAVPVEELTSGASGRIIPVFKNLRQSILSYESLRRSLLLIYSFFVWILLLLPRLHRISAAASPPSSPRTASASVRRRKFGVRRDEEDTMRRRALAEAIEMAAEDSSWCRWTTSLFFGVRRNALFCRSWLPVSGELRGILIIIHGLNEHSGRYSNFAKQLVSCKFGAYAMDWIGHGGSDGLHGYVPSLDHVVADTAAFLEKIKSENPDVPCFLFGHSTGGAVVLKAASYPHVEEMLEGVVLTSPALRVKPAHPIVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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